Хромосома 9

Хромосома человека

Хромосома 9
Пара хромосомы человека 9 после G-бэндинга :. Один от матери, другой от отца.
Пара хромосомы 9. в человеческом мужчине кариограмма
Характеристики
Длина (bp )	138,394,717 п.н.. (GRCh38 )
№ генов	739 (CCDS )
Тип	Аутосома
Положение центромеры	Субметацентрическое. (43,0 Мбит / с)
Полные списки генов
CCDS	Список генов
HGNC	Список генов
UniProt	Список генов
NCBI	Список генов
Внешние программы просмотра карт
Ensembl	Хромосома 9
Энтрез	Хромосома 9
NCBI	Хромосома 9
UCSC	Хромосома 9
Полные последовательности ДНК
RefSeq	NC_000009 (FASTA )
GenBank	CM000671 (FASTA )

Хромосома 9 - одна из 23 пар хромосом у людей. У людей обычно есть две копии этой хромосомы, как и у всех хромосом. Хромосома 9 охватывает около 138 миллионов пар оснований из нуклеиновых кислот (строительные блоки ДНК ) и составляет от 4,0 до 4,5% всей ДНК в клетки.

• 1 Гены
  • 1.1 Количество генов
  • 1.2 Список генов
• 2 Заболевания и расстройства
• 3 Цитогенетический диапазон
• 4 Ссылки
• 5 Внешние ссылки

Количество генов

Это некоторые из оценок количества генов в хромосоме 9 человека. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотации генома, их предсказания количество генов на каждой хромосоме варьируется (технические подробности см. в разделе прогнозирование генов ). Среди различных проектов проект совместной согласованной последовательности кодирования (CCDS ) использует чрезвычайно консервативную стратегию. Таким образом, прогноз числа генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего числа генов, кодирующих человеческий белок.

Оценка по	генам, кодирующим белок	Гены некодирующей РНК	Псевдогены	Источник	Дата выпуска
CCDS	739	—	—		08.09.2016
HGNC	749	246	590		12.05.2017
Ensembl	775	788	663		2017-03-29
UniProt	812	—	—		28.02.2018
NCBI	822	830	738		19.05.2017

Список генов

Ниже приводится неполный список генов на хромосоме 9 человека. Полный список см. По ссылке в информационном окне справа.

Ген ABO, который определяет группу крови ABO, расположен на длинном плече этой хромосомы. (Расположение: 9q34.2)

• ABO : ABO гликозилтрансферазы группы крови
• ACTL7A : кодирует белок актин-подобный белок 7A
• ADAMTS13 : Металлопептидаза ADAM с мотивом тромбоспондина типа 1, 13
• AIF1L : воспалительный фактор 1 аллотрансплантата, подобный
• ALAD : аминолевулинат, дельта-, дегидратаза
• : боковой амиотрофический склероз 4
• ANGPTL2 : ангиопоэтин-родственный белок 2
• ASS : аргининосукцинатсинтетаза
• BNC2 : цинковый палец базонуклин-2
• C9orf64 : открытая рамка считывания хромосомы 9 64
• C9orf78 : кодирует белок Неохарактеризованный белок C9orf78
• SHOC1 : дефицит в хиазмах 1
• C9orf135 : кодирует белок хромосому 9 открытая рамка считывания 135
• C9orf152 : открытая рамка считывания хромосомы 9 152
• CAAP1 : активность каспазы и ингибитор апоптоза 1
• CARD19 : член семейства доменов рекрутирования каспаз 19
• CBWD1 : белок 1, содержащий домен COBW
• CCDC1 80 : белок, содержащий домен спиральной спирали 180
• CCL21 : хемокин (мотив CC) лиганд 21, SCYA21
• CCL27 : хемокиновый лиганд (мотив CC) 27, SCYA27
• CFAP157 : белок, связанный с ресничками и жгутиками 157
• CHMP5 : заряженный мультивезикулярный белок тела 5
• CNTLN : центлеин
• COL5A1 : коллаген, тип V, альфа 1
• DDX31 : полипептид 31 DEAD-бокса
• DENND1A : белок 1A, содержащий домен DENN
• ENG : эндоглин (синдром Ослера-Ренду-Вебера 1)
• ENTPD2 : кодирование фермент эктонуклеозидтрифосфатдифосфогидролаза 2
• EQTN : экваторин
• FAM73B : семейство со сходством последовательностей 73 члена B
• FAM120A : семейство со сходством последовательностей 120 членов A
• FAM122a : кодирует белок Семейство со сходством последовательностей 122A
• FBP1 Фруктозо-1,6-бисфосфатаза 1
• FIBCD1 : кодирует белок Домен фибриногена C, содержащий 1
• FOCAD : фокадгезин
• FXN : фратаксин
• GALT : gala ктозо-1-фосфатуридилилтрансфераза
• GAS1 : белок 1, специфичный для остановки роста
• GCNT1 : глюкозаминил (N-ацетил) трансфераза 1
• GLE1L : нуклеопорин GLE1
• GPR107 : рецептор, связанный с G-белком 107
• GRHPR : глиоксилатредасдуктаза / гидроксипируватредуктаза
• GSN : цитоплазматический и плазменный гельсолин
• HAUS6 : субъединица 6 авгминоподобного комплекса HAUS
• IFN1 @ : Интерферон, тип 1, кластер
• IKBKAP : ингибитор энхансера гена каппа-легкого полипептида в B-клетках, белок, связанный с киназным комплексом
• INSL6 : инсулиноподобный 6
• ISCA1 : сборка железо-серного кластера 1, гомолог, митохондриальный
• KIAA1958 : белок KIAA1958
• KYAT1 : кинуренинаминотрансфераза 1
• LINGO2 : богатый лейцином повтор и домен Ig, содержащий 2
• MGC50722 : белок MGC50722, неохарактеризованный белок LOC399693
• MIR181A2HG, кодирующий белок ген хозяина MIR181A2
• MIR7-1 : микроРНК 7- 1
• MSMP : кодирование белка Micro семинопротеин, ассоциированный с простатой
• MTAP : S-метил-5'-тиоаденозинфосфорилаза
• NAA35 : кодирующий белок N (альфа) -ацетилтрансферазу 35, вспомогательная субъединица NatC
• NANS : N-ацетилнейраминатсинтаза
• NINJ1 : ниндзюрин-1
• NOL6 : ядрышковый белок 6
• NUDT2 : nudix гидролаза 2
• OLFM1 : ольфактомедин 1
• PHF2 : белок пальца 2 PHD
• PHPT1 : фосфогистидинфосфатаза 1
• PIP5K1B : фосфатидилинозитол-4-фосфат 5-киназа типа 1 бета
• PLAA : белок, активирующий фосфолипазу A-2
• PMPCA : альфа-субъединица процессинга митохондрий
• PRUNE2 : гомолог 2 белка чернослива
• RABGAP1 : RAB GTPase, активирующий белок 1
• REXO4 : экзонуклеаза РНК 4
• RNF183 : кодирующий белок белок безымянного пальца 183
• SARDH : саркозиндегидрогеназа, митохондриальная
• SIT1 : передача сигналов регулирующий порог трансмембранный адаптер 1
• SLC25A25-AS1 : кодирующий белок SLC25A25 антисептик nse РНК 1
• SPAG8 связанный со спермой антиген 8
• SPIN1 : spindlin-1
• ST6GALNAC4, кодирующий фермент ST6 (альфа-N-ацетил-нейраминил -2,3-бета-галактозил-1,3) -N-ацетилгалактозаминид альфа-2,6-сиалилтрансфераза 4, также известная как сиалилтрансфераза 3C (SIAT3-C) или сиалилтрансфераза 7D (SIAT7-D)
• ST6GALNAC6 : ST6 N-ацетилгалактозаминид альфа-2,6-сиалилтрансфераза 6
• STOML2 : стоматиноподобный белок 2
• STRBP : перинуклеарный РНК-связывающий белок сперматиды
• TEX10 : яичко экспрессируется 10
• TGFBR1 : трансформирующий фактор роста бета, рецептор типа I
• TMC1 : трансмембранный каналоподобный 1
• TMEM215 : кодирующий белок Трансмембранный белок 215
• TMEM268 : трансмембранный белок 268
• TOR2A, кодирующий белок Торсин-2A
• TSC1 : комплекс туберозного склероза]] 1
• TTC39B : тетратрикопептидный повторяющийся белок 39B
• UBAC1 : убиквитин-ассоциированный домен, содержащий белок 1
• UBAP1 : убиквитин-ассоциированный d белок 1
• UBAP2 : убиквитин-связанный белок 2
• ZBTB43 : цинковый палец и домен BTB, содержащий 43
• ZCCHC6 : цинковый палец, домен CCHC, содержащий 6
• ZDHHC21 : цинковый палец типа DHHC, содержащий 21
• ZNF79 : белок цинкового пальца 79
• ZNF510 : белок цинкового пальца 510

Следующие заболевания - это некоторые из генов, связанных с генами на хромосоме 9:

• ацитоз
• порфирия с дефицитом ALA-D
• боковой амиотрофический склероз
• цитруллинемия
• хронический миелогенный лейкоз (t9; 22 - Филадельфийская хромосома )
• Диафизарный медуллярный стеноз со злокачественной фиброзной гистиоситомой (DMS-MFH,)
• синдром Элерса-Данлоса
• семейная дисавтономия
• атаксия Фридрейха
• галактоземия
• или синдром Горлина синдром базально-клеточной карциномы
• синдром летальной врожденной контрактуры
• синдром ногтя-надколенника (NPS)
• несиндромная глухота
• ОКР
• истинная полицитемия
• порфирия
• первичная шумиха роксалурия
• болезнь Танжера
• тетрасомия 9p
• тромботическая тромбоцитопеническая пурпура
• трисомия 9
• туберозный склероз
• ЛПОНП-ассоциированная гипоплазия мозжечка

G-образные полосы человека 9 Идеограмма G-бэндинга хромосомы 9 человека с разрешением 850 ударов в час. Длина полосы на этой диаграмме пропорциональна длине пары оснований. Этот тип идеограммы обычно используется в браузерах генома (например, Ensembl, UCSC Genome Browser ). Шаблоны G-бэндинга хромосомы 9 человека в трех различных разрешениях (400, 550 и 850). Длина на этой диаграмме основана на идеограммах из ISCN (2013). Этот тип идеограммы представляет фактическую относительную длину полосы, наблюдаемую под микроскопом в разные моменты митотического процесса.

G-полосы человека хромосома 9 с разрешением 850 бит / с

Chr.	Arm	Band	ISCN. start	ISCN. stop	Basepair. start	Basepair. stop	Stain	Density
9	p	24,3	0	127	1	2,200,000	гнег
9	p	24,2	127	268	2,200,001	4,600,000	gpos	25
9	p	24,1	268	451	4,600,001	9,000,000	gneg
9	p	23	451	677	9,000,001	14,200,000	gpos	75
9	p	22,3	67 7	846	14,200,001	16,600,000	гнег
9	p	22.2	846	987	16,600,001	18,500,000	gpos	25
9	p	22.1	987	1085	18,500,001	19,900,000	gneg
9	p	21.3	1085	1297	19,900,001	25,600,000	gpos	100
9	p	21.2	1297	1395	25,600,001	28,000,000	гнег
9	p	21,1	1395	1621	28,000,001	33,200,000	gpos	100
9	p	13,3	1621	1917	33,200,001	36,300,000	gneg
9	p	13.2	1917	2030	36,300,001	37,900,000	gpos	25
9	p	13.1	2030	2171	37,900,001	39,000,000	gneg
9	p	12	2171	2312	39,000,001	40,000,000	gpos	50
9	p	11.2	2312	2523	40,000, 001	42,200,000	gneg
9	p	11.1	2523	2650	42,200,001	43,000,000	acen
9	q	11	2650	2876	43,000,001	45,500,000	acen
9	q	12	2876	3468	45,500,001	61,500,000	gvar
9	q	13	3468	3609	61,500,001	65,000,000	gneg
9	q	21.11	3609	3792	65,000,001	69,300,000	gpos	25
9	q	21,12	3792	3876	69,300,001	71,300,000	гнег
9	q	21,13	3876	4060	71,300,001	76,600,000	gpos	50
9	q	21.2	4060	4229	76,600,001	78,500,000	gneg
9	q	21.31	4229	4440	78,500,001	81,500,000	gpos	50
9	q	21.32	4440	4638	81,500,001	84,300,000	гнег
9	q	21,33	4638	4835	84,300,001	87,800,000	gpos	50
9	q	22.1	4835	5074	87,800,001	89,200,000	gneg
9	q	22.2	5074	5173	89,200,001	91,200,000	gpos	25
9	q	22.31	5173	5314	91,200,001	93,900,000	гнег
9	q	22,32	5314	5455	93,900,001	96,500,000	gpos	25
9	q	22,33	5455	5638	96,500,001	99,800,000	gneg
9	q	31,1	5638	5892	99,800,001	105,400,000	gpos	100
9	q	31.2	5892	6005	105,400,001	108,500,000	gneg
9	q	31,3	6005	6146	108,500,001	112,100,000	gpos	25
9	q	32	6146	6456	112,100,001	114,900,000	gneg
9	q	33,1	6456	6681	114 900,0 01	119,800,000	gpos	75
9	q	33.2	6681	6822	119,800,001	123,100,000	gneg
9	q	33.3	6822	6949	123,100,001	127,500,000	gpos	25
9	q	34,11	6949	7217	127,500,001	130,600,000	гнег
9	q	34,12	7217	7302	130,600,001	131,100,000	gpos	25
9	q	34,13	7302	7443	131,100,001	133,100,000	gneg
9	q	34.2	7443	7555	133,100,001	134,500,000	gpos	25
9	q	34,3	7555	7950	134 500 001	138 394 717	gneg

На Викискладе есть средства массовой информации, связанные с хромосомой 9 человека.

• Национальные Институты здоровья. «Хромосома 9». Домашний справочник по генетике. Проверено 6 мая 2017 г.
• «Хромосома 9». Информационный архив проекта "Геном человека" 1990–2003 гг. Проверено 06.05.2017.