Хромосома 11

редактировать
Хромосома 11
Мужской кариотп человека высокого разрешения - Хромосома 11 cropped.png Пара хромосомы 11 человека после G-бэндинга.. Один от матери, одна от отца.
Человеческий мужской кариотп высокий разрешение - Хромосома 11.png Пара хромосомы 11. в человеческом мужчине кариограмма.
Характеристики
Длина (bp )135,086,622 п.н.. (GRCh38 )
No. генов 1224 (CCDS )
ТипАутосома
Положение центромеры Субметацентрическое. (53,4 Mbp)
Полные списки генов
CCDS Список генов
HGNC Список генов
UniProt Список генов
NCBI Список генов
Внешние программы просмотра карт
Ensembl Хромосома 11
Entrez Хромосома 11
NCBI Хромосома 11
UCSC Хромосома 11
Полные последовательности ДНК
RefSeq NC_000011 (FASTA )
GenBank CM000673 (FASTA )

Хромосома 11 - одна из 23 пар хромосом у людей. Обычно у людей есть две копии этой хромосомы. хромосома. Хромосома 11 охватывает около 135 миллионов пар оснований (здание материал ДНК ) и составляет от 4 до 4,5 процентов от общей ДНК в клетках. более короткое плечо (p-плечо) обозначается 11p, а более длинное плечо (q-плечо) - 11q . При примерно 21,5 генов на мегабазу хромосома 11 является одной из самых богатых генами и богатых болезнями хромосом в геноме человека.

Более 40% из 856 Гены обонятельных рецепторов в геноме человека расположены в 28 кластерах с одним и несколькими генами вдоль хромосомы.

Содержание

  • 1 Ген
    • 1.1 Количество генов
    • 1.2 Список генов
  • 2 Заболевания и расстройства
  • 3 Цитогенетический диапазон
  • 4 Ссылки
  • 5 Внешние ссылки

Ген

Количество генов

Ниже приведены некоторые оценки количества генов в хромосоме 11 человека. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотации генома, их предсказания количество генов на каждой хромосоме варьируется (технические подробности см. в разделе прогнозирование генов ). Среди различных проектов совместный проект согласованной последовательности кодирования (CCDS ) использует чрезвычайно консервативную стратегию. Таким образом, прогноз количества генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего количества генов, кодирующих белок человека.

Оценка погенам, кодирующим белок генам некодирующей РНК Псевдогенам ИсточникДата выпуска
CCDS 1,2242016-09-08
HGNC 1,2622716662017 -05-12
Ensembl 1,3011,06081129.03.2017
UniProt 1,32728.02.2018
NCBI 1,3148608392017-05-19

Список генов

Ниже приводится частичный список генов в хромосома человека 11. Полный список можно найти по ссылкам в информационном окне справа.

  • ACAT1 : ацетил-кофермент A, ацетилтрансфераза 1 (ацетоацетил-кофермент A тиолаза)
  • ACRV1 : кодирующий белок Акросомный белок SP-10
  • AKIP1 : белок 1 <510, взаимодействующий с A-киназой>ALKBH3, кодирующий белок, гомолог 3 AlkB, альфа-кетоглутаратзависимую диоксигеназу
  • AMOTL1 : ангиомотин-подобный белок 1
  • AMPD3 : кодирующий фермент AMP-дезаминазу 3
  • API5 : кодирующий белок ингибитор апоптоза 5
  • APLNR : рецептор апелина (рецептор APJ)
  • APOA4 : аполипопротеин A-IV
  • ARCN1 кодирующий белок Archain 1
  • ASRGL1 : кодирующий фермент L-аспарагиназу
  • ATM : мутированная атаксия телеангиэктазия (включает группы комплементации A, C и D)
  • B3GNT1 : кодирующий фермент N-ацетиллактозаминид бета-1, 3-N-ацетилглюкозаминилтрансфераза
  • BDNF : секретирует BDNF, член семейства белков нейротрофинов
  • C11orf1 : кодирующий белок
  • C11orf16 : кодирующий белок Неохарактеризованный белок C11orf16
  • C11orf49 : en кодирующий белок UPF0705 белок C11orf49
  • C11orf52 кодирующий белок C11orf52
  • C11orf54 : кодирующий белок Сложный эфир гидролазы C11orf54
  • C11orf86 : кодирующий белок Неохарактеризованный белок C11orf86
  • C1QTNF4 C1q и белок 4, связанный с фактором некроза опухоли
  • C1QTNF5 : кодирующий белок C1q и белок 5, связанный с фактором некроза опухоли
  • CAPRIN1 : кодирующий белок, белок 1, связанный с клеточным циклом
  • CCDC90B : домен спиральной спирали, содержащий 90B
  • CCL9 : хемокиновый (мотив CC) лиганд 9
  • CD81 : кластер дифференцировки 81
  • CDHR5 : член семейства, родственный кадгерину 5
  • COMMD9 : белок 9, содержащий домен COMM
  • CPSF7 : субъединица 7 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования
  • CPT1A : карнитинпальмитоилтрансфераза 1A (печень)
  • CREBZF, кодирующий белок CREB / ATF Фактор транскрипции bZIP
  • DAK : Триокиназа / FMNциклаза
  • DDI1 : кодирующий белок, индуцируемый повреждением ДНК, 1 гомолог 1 (S. cerevisiae)
  • DGAT2 кодирующий белок Диацилглицерин-O-ацилтрансферазу 2
  • DHCR7 : 7-дегидрохолестеринредуктаза
  • DKK3 : белок 3, родственный Диккопфу
  • DPF2 : двойной PHD finger 2
  • DRD4 : дофаминовый рецептор D4 в точке 11p15.5
  • DSCAML1 : кодирующая молекула клеточной адгезии синдрома Дауна, такая как 1
  • EI24 : гомолог белка 2.4, индуцированный этопозидом
  • FAM118B : кодирующее семейство белков со сходством последовательностей 118, член B
  • FAM76B : семейство со сходством последовательностей 76, член B
  • FAR1 : жирная ацил-коА редуктаза 1
  • FAT3 : жирный атипичный кадгерин 3
  • FHIP : FTS и Hook-взаимодействующий белок
  • FNBP4 : Formin-связывающий белок 4
  • GLB1L3 : галактозидаза, бета-1-подобный 3
  • GLYAT : Глицин-N-ацилтрансфераза
  • GLYATL2, кодирующая белок, глицин-N-ацилтрансферазу, подобный 2
  • GPHA2 : Гликопротеиновый гормон альфа-2
  • GYLTL1B : Гликозилтрансферазоподобный белок LARGE2
  • HBB : гемоглобин, бета
  • HBBP1 : en кодирующий белок Гемоглобин, бета-псевдоген 1
  • HIKESHI : хромосома 11, открытая рамка считывания 73
  • HMBS : гидроксиметилбилан VIIA
  • HRASLS3 : адипозофосфолипаза A2
  • HTATIP2 : ВИЧ-1 Tat интерактивный белок 2
  • HYOU1 : белок 1 с повышенной гипоксией
  • IFITM2, кодирующий белок Интерферон-индуцированный трансмембранный белок 2
  • IFT46 : гомолог белка 46 внутрилагеллярного транспорта
  • INS : ген инсулина
  • KDM2A : лизин-деметилаза 2A
  • KIAA1549L кодирующий белок KIAA1549-подобный
  • LPXN : лейпаксин
  • LRFN4 кодирующий белок, богатый лейцином повтор и домен фибронектина типа III, содержащий 4
  • MADD : белок домена смерти, активирующий киназу MAP
  • MEN1 : Множественная эндокринная неоплазия 1 типа
  • MIRLET7A2 : микроРНК let- 7a-2
  • MMP7 : матричные металлопротеиназы (семейство MMP)
  • MOGAT2 : моноацилглицерин-O-ацилтрансфераза 2
  • MTRNR2L8 : кодирующий белок MT-RNR2-подобный 8
  • NADSYN1 : НАД-синтетаза 1
  • НА P1L4 : белок сборки нуклеосомы 1-подобный 4
  • NFRKB : ядерный фактор, связанный с каппа-B-связывающим белком
  • NNMT : никотинамид-N-метилтрансфераза
  • NRGN : нейрогранин
  • P53AIP1 : регулируемый p53 белок 1, индуцирующий апоптоз
  • PAX6 : парный блок 6
  • PCNX3, кодирующий белок гомолог 3 Pecanex
  • PGA3 кодирующий белок пепсиноген 3, группа I (пепсиноген A)
  • PIWIL4, кодирующий белок Piwi-подобное РНК-опосредованное подавление гена 4
  • PRR5L : богатый пролином 5 подобный
  • PTPRCAP : рецептор протеинтирозинфосфатазы типа C ассоциированный белок
  • PTS : 6-пирувоилтетрагидроптеринсинтаза
  • QSER1 : белок 1, богатый глутаминсерином
  • RAG1 / RAG2 : гены, активирующие рекомбинацию
  • RELT : рецептор фактора некроза опухоли
  • REXO2 : экзонуклеаза 2 РНК
  • RNH1 : ингибитор 1 рибонуклеазы
  • RNU2-2 : кодирующая белковая РНК, малое ядро ​​U2 2
  • ROM1 : белок 1 мембраны внешнего сегмента сетчатки
  • RPL27A : кодировать белок 60S рибосомный белок L27a
  • RPL36A : кодирующий белок 60S рибосомный белок L36a
  • RSF1 : фактор ремоделирования и спейсинга 1
  • SAA1 : сывороточный амилоид A1
  • SAA2 : сывороточный амилоид A2
  • SAC3D1 : белок 1, содержащий домен SAC3
  • SART1 : антиген плоскоклеточной карциномы, распознаваемый Т-клетками 1
  • SBF2 : SET связывающий фактор 2
  • SCGB1D2 : член 1D семейства секретоглобинов 2
  • SESN3 кодирующий белок Сестрин 3
  • SIDT2 кодирующий белок SID1 член трансмембранного семейства 2
  • SLC17A6 : кодирующий белок Семейство растворенных носителей 17 (переносчик везикулярного глутамата), член 6
  • SMAP : малый кислый белок
  • SMPD1 : сфингомиелинфосфодиэстераза 1, кислый лизосомальный (кислая сфингомиелиназа)
  • SPA17 : аутоантигенный белок спермы 17
  • SRPRA : альфа-субъединица рецептора Srp
  • TAF1D : субъединица D РНК-полимеразы 1 фактора, ассоциированного с ТАТА-боксом, субъединица D
  • TALDO1, кодирующий белок трансальдолазу 1
  • TBRG1 : тра Бета-регулятор 1 nsforming фактора роста
  • TECTA : текторин альфа (несиндромная глухота)
  • TH : тирозингидроксилаза
  • THRSP : индуцируемый тироидным гормоном белок печени
  • THYN1 : ядерный белок тимоцитов 1
  • TIMM10 : транслоказа внутренней митохондриальной мембраны 10
  • TIMM10B : Митохондриальная импортная субъединица транслоказы внутренней мембраны Tim9 B
  • TM7SF2 : трансмембранный член надсемейства 7 2
  • TMEM109 : кодирующий белок Трансмембранный белок 109
  • TMEM123 : трансмембранный белок 123
  • TMEM126B : трансмембранный белок 126B
  • TMEM134 : трансмембранный белок 134
  • TMEM25 : трансмембранный белок 25
  • TP53I11 : опухолевый белок 53, индуцируемый белок 11
  • TRAPPC4 : субъединица 4 комплекса частиц транспортирующего белка
  • TRPT1 : тРНК 2'-фосфотрансфераза 1
  • UNC93B1 : Гомолог Unc-93 B1
  • UPK2 : уроплакин-2
  • USH1C : синдром Ушера 1C (аутосомно-рецессивный, тяжелый)
  • USP47 : убиквитинспецифическая пептидаза 4 7
  • UVRAG : ассоциированная устойчивость к УФ-излучению
  • VPS26B : сортировка вакуолярного белка 26, гомолог B
  • VSIG2 : V-набор и домен иммуноглобулина, содержащий 2
  • WT1 : опухоль Вильмса белок
  • YIF1A : гомолог A взаимодействующего фактора Yip1
  • ZFP91-CNTF
  • ZNF408 : белок цинкового пальца 408

Заболевания и расстройства

В Викиновостях есть новости по теме:

Следующие заболевания и расстройства связаны с генами на хромосоме 11:

Цитогенетическая полоса

Идеограммы G-бэндов 11-й хромосомы человека Идеограмма G-бэндов 11-й хромосомы человека с разрешением 850 бит / ч. Длина полосы на этой диаграмме пропорциональна длине пары оснований. Этот тип идеограммы обычно используется в браузерах генома (например, Ensembl, UCSC Genome Browser ). Шаблоны G-бэндинга хромосомы 11 человека в трех различных разрешениях (400, 550 и 850). Длина на этой диаграмме основана на идеограммах из ISCN (2013). Этот тип идеограммы представляет фактическую относительную длину полосы, наблюдаемую под микроскопом в разные моменты митотического процесса.
G-полосы человека хромосома 11 с разрешением 850 бит / с
Chr.ArmBandISCN. startISCN. stopBasepair. startBasepair. stopStainПлотность
11p15,5023012,800,000гнег
11p15,42304612,800,00111,700,000gpos50
11p15,346174511,700,00113,800,000gneg
11p15,274593513,800,00116,900,000gpos50
11p15.1935124616,900,00122,000,000gneg
11p14,31246149022,000,00126,200,000gpos100
11p14.21490154526,200,00127,200,000gneg
11p14.11545177527,200,00131,000,000gpos75
11p131775211431,000,00136,400,000gneg
11p122114235736,400,00143,400,000gpos100
11p11.22357265543,400,00148,800,000gneg
11p11,122655287248,800,00151,000,000gpos75
11p11.112872303551,000,00153,400,000acen
11q113035319753,400,00155,800,000acen
11q12.13197341455,800,00160,100,000gpos75
11q12,2341435506 0,100,00161,900,000gneg
11q12,33550368561,900,00163,600,000gpos25
11q13.13685403763,600,00166,100,000гнег
11q13.24037418666,100,00168,700,000gpos25
11q13,34186451268,700,00170,500,000gneg
11q13,44512468870,500,00175,500,000gpos50
11q13,54688487775,500,00177,400,000gneg
11q14.14877514877,400,00185,900,000gpos100
11q14.25148525785,900,00188,600,000gneg
11q14,35257547488,600,00193,000,000gpos100
11q215474569093,000,00197,400,000gneg
11q22.15690593497,400,001102,300,000gpos100
11q22.259346070102,300,001103,000,000gneg
11q22.360706300103,000,001110,600,000gpos100
11q23.163006503110,600,001112,700,000гнег
11q23.265036693112,700,001114,600,000gpos50
11q23,366937167114,600,001121,300,000гнег
11q24,171677316121,300,001124,000,000gpos50
11q24.273167533124,000,001127,900,000gneg
11q24,375337695127,900,001130,900,000gpos50
11q2576957980130,900,001135,086,622гнег

Ссылки

Внешние ссылки

Викискладе есть медиафайлы, связанные с Human chr омосома 11.
  • Национальные институты здравоохранения. «Хромосома 11». Домашний справочник по генетике. Проверено 6 мая 2017 г.
  • «Хромосома 11». Информационный архив проекта "Геном человека" 1990–2003 гг. Проверено 06.05.2017.
Последняя правка сделана 2021-05-15 06:06:34
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте