Хромосома 11
редактировать
Хромосома 11 - одна из 23 пар хромосом у людей. Обычно у людей есть две копии этой хромосомы. хромосома. Хромосома 11 охватывает около 135 миллионов пар оснований (здание материал ДНК ) и составляет от 4 до 4,5 процентов от общей ДНК в клетках. более короткое плечо (p-плечо) обозначается 11p, а более длинное плечо (q-плечо) - 11q . При примерно 21,5 генов на мегабазу хромосома 11 является одной из самых богатых генами и богатых болезнями хромосом в геноме человека.
Более 40% из 856 Гены обонятельных рецепторов в геноме человека расположены в 28 кластерах с одним и несколькими генами вдоль хромосомы.
Содержание
- 1 Ген
- 1.1 Количество генов
- 1.2 Список генов
- 2 Заболевания и расстройства
- 3 Цитогенетический диапазон
- 4 Ссылки
- 5 Внешние ссылки
Ген
Количество генов
Ниже приведены некоторые оценки количества генов в хромосоме 11 человека. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотации генома, их предсказания количество генов на каждой хромосоме варьируется (технические подробности см. в разделе прогнозирование генов ). Среди различных проектов совместный проект согласованной последовательности кодирования (CCDS ) использует чрезвычайно консервативную стратегию. Таким образом, прогноз количества генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего количества генов, кодирующих белок человека.
Список генов
Ниже приводится частичный список генов в хромосома человека 11. Полный список можно найти по ссылкам в информационном окне справа.
- ACAT1 : ацетил-кофермент A, ацетилтрансфераза 1 (ацетоацетил-кофермент A тиолаза)
- ACRV1 : кодирующий белок Акросомный белок SP-10
- AKIP1 : белок 1 <510, взаимодействующий с A-киназой>ALKBH3, кодирующий белок, гомолог 3 AlkB, альфа-кетоглутаратзависимую диоксигеназу
- AMOTL1 : ангиомотин-подобный белок 1
- AMPD3 : кодирующий фермент AMP-дезаминазу 3
- API5 : кодирующий белок ингибитор апоптоза 5
- APLNR : рецептор апелина (рецептор APJ)
- APOA4 : аполипопротеин A-IV
- ARCN1 кодирующий белок Archain 1
- ASRGL1 : кодирующий фермент L-аспарагиназу
- ATM : мутированная атаксия телеангиэктазия (включает группы комплементации A, C и D)
- B3GNT1 : кодирующий фермент N-ацетиллактозаминид бета-1, 3-N-ацетилглюкозаминилтрансфераза
- BDNF : секретирует BDNF, член семейства белков нейротрофинов
- C11orf1 : кодирующий белок
- C11orf16 : кодирующий белок Неохарактеризованный белок C11orf16
- C11orf49 : en кодирующий белок UPF0705 белок C11orf49
- C11orf52 кодирующий белок C11orf52
- C11orf54 : кодирующий белок Сложный эфир гидролазы C11orf54
- C11orf86 : кодирующий белок Неохарактеризованный белок C11orf86
- C1QTNF4 C1q и белок 4, связанный с фактором некроза опухоли
- C1QTNF5 : кодирующий белок C1q и белок 5, связанный с фактором некроза опухоли
- CAPRIN1 : кодирующий белок, белок 1, связанный с клеточным циклом
- CCDC90B : домен спиральной спирали, содержащий 90B
- CCL9 : хемокиновый (мотив CC) лиганд 9
- CD81 : кластер дифференцировки 81
- CDHR5 : член семейства, родственный кадгерину 5
- COMMD9 : белок 9, содержащий домен COMM
- CPSF7 : субъединица 7 фактора специфичности расщепления и полиаденилирования
- CPT1A : карнитинпальмитоилтрансфераза 1A (печень)
- CREBZF, кодирующий белок CREB / ATF Фактор транскрипции bZIP
- DAK : Триокиназа / FMNциклаза
- DDI1 : кодирующий белок, индуцируемый повреждением ДНК, 1 гомолог 1 (S. cerevisiae)
- DGAT2 кодирующий белок Диацилглицерин-O-ацилтрансферазу 2
- DHCR7 : 7-дегидрохолестеринредуктаза
- DKK3 : белок 3, родственный Диккопфу
- DPF2 : двойной PHD finger 2
- DRD4 : дофаминовый рецептор D4 в точке 11p15.5
- DSCAML1 : кодирующая молекула клеточной адгезии синдрома Дауна, такая как 1
- EI24 : гомолог белка 2.4, индуцированный этопозидом
- FAM118B : кодирующее семейство белков со сходством последовательностей 118, член B
- FAM76B : семейство со сходством последовательностей 76, член B
- FAR1 : жирная ацил-коА редуктаза 1
- FAT3 : жирный атипичный кадгерин 3
- FHIP : FTS и Hook-взаимодействующий белок
- FNBP4 : Formin-связывающий белок 4
- GLB1L3 : галактозидаза, бета-1-подобный 3
- GLYAT : Глицин-N-ацилтрансфераза
- GLYATL2, кодирующая белок, глицин-N-ацилтрансферазу, подобный 2
- GPHA2 : Гликопротеиновый гормон альфа-2
- GYLTL1B : Гликозилтрансферазоподобный белок LARGE2
- HBB : гемоглобин, бета
- HBBP1 : en кодирующий белок Гемоглобин, бета-псевдоген 1
- HIKESHI : хромосома 11, открытая рамка считывания 73
- HMBS : гидроксиметилбилан VIIA
- HRASLS3 : адипозофосфолипаза A2
- HTATIP2 : ВИЧ-1 Tat интерактивный белок 2
- HYOU1 : белок 1 с повышенной гипоксией
- IFITM2, кодирующий белок Интерферон-индуцированный трансмембранный белок 2
- IFT46 : гомолог белка 46 внутрилагеллярного транспорта
- INS : ген инсулина
- KDM2A : лизин-деметилаза 2A
- KIAA1549L кодирующий белок KIAA1549-подобный
- LPXN : лейпаксин
- LRFN4 кодирующий белок, богатый лейцином повтор и домен фибронектина типа III, содержащий 4
- MADD : белок домена смерти, активирующий киназу MAP
- MEN1 : Множественная эндокринная неоплазия 1 типа
- MIRLET7A2 : микроРНК let- 7a-2
- MMP7 : матричные металлопротеиназы (семейство MMP)
- MOGAT2 : моноацилглицерин-O-ацилтрансфераза 2
- MTRNR2L8 : кодирующий белок MT-RNR2-подобный 8
- NADSYN1 : НАД-синтетаза 1
- НА P1L4 : белок сборки нуклеосомы 1-подобный 4
- NFRKB : ядерный фактор, связанный с каппа-B-связывающим белком
- NNMT : никотинамид-N-метилтрансфераза
- NRGN : нейрогранин
- P53AIP1 : регулируемый p53 белок 1, индуцирующий апоптоз
- PAX6 : парный блок 6
- PCNX3, кодирующий белок гомолог 3 Pecanex
- PGA3 кодирующий белок пепсиноген 3, группа I (пепсиноген A)
- PIWIL4, кодирующий белок Piwi-подобное РНК-опосредованное подавление гена 4
- PRR5L : богатый пролином 5 подобный
- PTPRCAP : рецептор протеинтирозинфосфатазы типа C ассоциированный белок
- PTS : 6-пирувоилтетрагидроптеринсинтаза
- QSER1 : белок 1, богатый глутаминсерином
- RAG1 / RAG2 : гены, активирующие рекомбинацию
- RELT : рецептор фактора некроза опухоли
- REXO2 : экзонуклеаза 2 РНК
- RNH1 : ингибитор 1 рибонуклеазы
- RNU2-2 : кодирующая белковая РНК, малое ядро U2 2
- ROM1 : белок 1 мембраны внешнего сегмента сетчатки
- RPL27A : кодировать белок 60S рибосомный белок L27a
- RPL36A : кодирующий белок 60S рибосомный белок L36a
- RSF1 : фактор ремоделирования и спейсинга 1
- SAA1 : сывороточный амилоид A1
- SAA2 : сывороточный амилоид A2
- SAC3D1 : белок 1, содержащий домен SAC3
- SART1 : антиген плоскоклеточной карциномы, распознаваемый Т-клетками 1
- SBF2 : SET связывающий фактор 2
- SCGB1D2 : член 1D семейства секретоглобинов 2
- SESN3 кодирующий белок Сестрин 3
- SIDT2 кодирующий белок SID1 член трансмембранного семейства 2
- SLC17A6 : кодирующий белок Семейство растворенных носителей 17 (переносчик везикулярного глутамата), член 6
- SMAP : малый кислый белок
- SMPD1 : сфингомиелинфосфодиэстераза 1, кислый лизосомальный (кислая сфингомиелиназа)
- SPA17 : аутоантигенный белок спермы 17
- SRPRA : альфа-субъединица рецептора Srp
- TAF1D : субъединица D РНК-полимеразы 1 фактора, ассоциированного с ТАТА-боксом, субъединица D
- TALDO1, кодирующий белок трансальдолазу 1
- TBRG1 : тра Бета-регулятор 1 nsforming фактора роста
- TECTA : текторин альфа (несиндромная глухота)
- TH : тирозингидроксилаза
- THRSP : индуцируемый тироидным гормоном белок печени
- THYN1 : ядерный белок тимоцитов 1
- TIMM10 : транслоказа внутренней митохондриальной мембраны 10
- TIMM10B : Митохондриальная импортная субъединица транслоказы внутренней мембраны Tim9 B
- TM7SF2 : трансмембранный член надсемейства 7 2
- TMEM109 : кодирующий белок Трансмембранный белок 109
- TMEM123 : трансмембранный белок 123
- TMEM126B : трансмембранный белок 126B
- TMEM134 : трансмембранный белок 134
- TMEM25 : трансмембранный белок 25
- TP53I11 : опухолевый белок 53, индуцируемый белок 11
- TRAPPC4 : субъединица 4 комплекса частиц транспортирующего белка
- TRPT1 : тРНК 2'-фосфотрансфераза 1
- UNC93B1 : Гомолог Unc-93 B1
- UPK2 : уроплакин-2
- USH1C : синдром Ушера 1C (аутосомно-рецессивный, тяжелый)
- USP47 : убиквитинспецифическая пептидаза 4 7
- UVRAG : ассоциированная устойчивость к УФ-излучению
- VPS26B : сортировка вакуолярного белка 26, гомолог B
- VSIG2 : V-набор и домен иммуноглобулина, содержащий 2
- WT1 : опухоль Вильмса белок
- YIF1A : гомолог A взаимодействующего фактора Yip1
- ZFP91-CNTF
- ZNF408 : белок цинкового пальца 408
Заболевания и расстройства
| В Викиновостях есть новости по теме: |
Следующие заболевания и расстройства связаны с генами на хромосоме 11:
Цитогенетическая полоса
Идеограммы G-бэндов 11-й хромосомы человека
Идеограмма G-бэндов 11-й хромосомы человека с разрешением 850 бит / ч. Длина полосы на этой диаграмме пропорциональна длине пары оснований. Этот тип идеограммы обычно используется в браузерах генома (например,
Ensembl,
UCSC Genome Browser ).
Шаблоны G-бэндинга хромосомы 11 человека в трех различных разрешениях (400, 550 и 850). Длина на этой диаграмме основана на идеограммах из ISCN (2013). Этот тип идеограммы представляет фактическую относительную длину полосы, наблюдаемую под микроскопом в разные моменты
митотического процесса.
G-полосы человека хромосома 11 с разрешением 850 бит / сChr. | Arm | Band | ISCN. start | ISCN. stop | Basepair. start | Basepair. stop | Stain | Плотность |
---|
11 | p | 15,5 | 0 | 230 | 1 | 2,800,000 | гнег | |
11 | p | 15,4 | 230 | 461 | 2,800,001 | 11,700,000 | gpos | 50 |
11 | p | 15,3 | 461 | 745 | 11,700,001 | 13,800,000 | gneg | |
11 | p | 15,2 | 745 | 935 | 13,800,001 | 16,900,000 | gpos | 50 |
11 | p | 15.1 | 935 | 1246 | 16,900,001 | 22,000,000 | gneg | |
11 | p | 14,3 | 1246 | 1490 | 22,000,001 | 26,200,000 | gpos | 100 |
11 | p | 14.2 | 1490 | 1545 | 26,200,001 | 27,200,000 | gneg | |
11 | p | 14.1 | 1545 | 1775 | 27,200,001 | 31,000,000 | gpos | 75 |
11 | p | 13 | 1775 | 2114 | 31,000,001 | 36,400,000 | gneg | |
11 | p | 12 | 2114 | 2357 | 36,400,001 | 43,400,000 | gpos | 100 |
11 | p | 11.2 | 2357 | 2655 | 43,400,001 | 48,800,000 | gneg | |
11 | p | 11,12 | 2655 | 2872 | 48,800,001 | 51,000,000 | gpos | 75 |
11 | p | 11.11 | 2872 | 3035 | 51,000,001 | 53,400,000 | acen | |
11 | q | 11 | 3035 | 3197 | 53,400,001 | 55,800,000 | acen | |
11 | q | 12.1 | 3197 | 3414 | 55,800,001 | 60,100,000 | gpos | 75 |
11 | q | 12,2 | 3414 | 3550 | 6 0,100,001 | 61,900,000 | gneg | |
11 | q | 12,3 | 3550 | 3685 | 61,900,001 | 63,600,000 | gpos | 25 |
11 | q | 13.1 | 3685 | 4037 | 63,600,001 | 66,100,000 | гнег | |
11 | q | 13.2 | 4037 | 4186 | 66,100,001 | 68,700,000 | gpos | 25 |
11 | q | 13,3 | 4186 | 4512 | 68,700,001 | 70,500,000 | gneg | |
11 | q | 13,4 | 4512 | 4688 | 70,500,001 | 75,500,000 | gpos | 50 |
11 | q | 13,5 | 4688 | 4877 | 75,500,001 | 77,400,000 | gneg | |
11 | q | 14.1 | 4877 | 5148 | 77,400,001 | 85,900,000 | gpos | 100 |
11 | q | 14.2 | 5148 | 5257 | 85,900,001 | 88,600,000 | gneg | |
11 | q | 14,3 | 5257 | 5474 | 88,600,001 | 93,000,000 | gpos | 100 |
11 | q | 21 | 5474 | 5690 | 93,000,001 | 97,400,000 | gneg | |
11 | q | 22.1 | 5690 | 5934 | 97,400,001 | 102,300,000 | gpos | 100 |
11 | q | 22.2 | 5934 | 6070 | 102,300,001 | 103,000,000 | gneg | |
11 | q | 22.3 | 6070 | 6300 | 103,000,001 | 110,600,000 | gpos | 100 |
11 | q | 23.1 | 6300 | 6503 | 110,600,001 | 112,700,000 | гнег | |
11 | q | 23.2 | 6503 | 6693 | 112,700,001 | 114,600,000 | gpos | 50 |
11 | q | 23,3 | 6693 | 7167 | 114,600,001 | 121,300,000 | гнег | |
11 | q | 24,1 | 7167 | 7316 | 121,300,001 | 124,000,000 | gpos | 50 |
11 | q | 24.2 | 7316 | 7533 | 124,000,001 | 127,900,000 | gneg | |
11 | q | 24,3 | 7533 | 7695 | 127,900,001 | 130,900,000 | gpos | 50 |
11 | q | 25 | 7695 | 7980 | 130,900,001 | 135,086,622 | гнег | |
Ссылки
Внешние ссылки
| Викискладе есть медиафайлы, связанные с Human chr омосома 11. |
- Национальные институты здравоохранения. «Хромосома 11». Домашний справочник по генетике. Проверено 6 мая 2017 г.
- «Хромосома 11». Информационный архив проекта "Геном человека" 1990–2003 гг. Проверено 06.05.2017.