Chordopoxvirinae | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Вариднавирия |
Королевство: | Bamfordvirae |
Тип: | Nucleocytoviricota |
Класс: | Pokkesviricetes |
Порядок: | Chitovirales |
Семейство: | Poxviridae |
Подсемейство: | Chordopoxvirinae |
Род | |
См. Текст |
Chordopoxvirinae является подсемейством вирусов семейства Poxviridae. Естественными хозяевами служат люди, позвоночные и членистоногие. В настоящее время в это подсемейство входит 52 вида, разделенных на 18 родов. Заболевания, связанные с этим подсемейством, включают натуральную оспу.
. Четыре рода в этом подсемействе содержат виды, инфицированные людей: Molluscipoxvirus, Orthopoxvirus, Parapoxvirus и Ятапоксвирус.
Вирионы обычно обернуты через внутриклеточную зрелую форму вириона вируса, которая содержит другую оболочку и также является инфекционной. Они различаются по своей форме в зависимости от вида, но обычно имеют форму кирпича или овальную форму, похожую на округлый кирпич, потому что они окружены эндоплазматической сетью. Вирион исключительно большой, около 200 нм в диаметре и 300 нм в длину, и несет свой геном в одноцепочечном сегменте ДНК. Геномы линейны, их длина составляет около 130-375 килобайт.
Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
---|---|---|---|---|---|
Yatapoxvirus | Кирпичи | Развернуты | Линейные | Одночастные | |
Цервидпоксвирус | Кирпичи | Обволакивает | Линейный | Монодостаточный | |
Лепорипоксвирус | Кирпичообразный | Разработанный | Линейный | Монораздел | |
Суипоксвирус | В форме кирпича | Обволакивающий | Линейный | Однокомпонентный | |
Вирус моллюсков | Кирпичей формы | Развернутый | Линейный | Монодостаточный | |
Крокодилидпоксвирус | Яйцевидный | Развитый | Линейный | Монодостаточный | |
Каприпоксвирус | Кирпичи формы | Обволакивающий | Линейный | Однокомпонентный | |
Ортопоксвирус | Кирпичный | Развернутый | Линейный | Одночастный | |
Avipoxvirus | В форме кирпича | Enveloped | Linear | Monopartite | |
Parapoxvirus | Ovoid | Enveloped | Линейный | Мо nopartite |
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в хозяйскую клетку достигается прикреплением вирусных белков к гликозаминогликанам хозяина (ГАГ), которые опосредуют эндоцитоз вируса в хозяйскую клетку. Слияние с плазматической мембраной высвобождает ядро в цитоплазму хозяина. На ранней стадии ранние гены транскрибируются в цитоплазму вирусной РНК-полимеразой. Раннее выражение начинается через 30 минут после заражения. Ядро полностью не покрыто, поскольку заканчивается ранняя экспрессия, тогда вирусный геном остается в цитоплазме. В промежуточной фазе экспрессируются промежуточные гены, запускающие репликацию геномной ДНК примерно через 100 минут после заражения. На поздней стадии поздние гены экспрессируются от 140 минут до 48 часов после заражения, продуцируя все структурные белки. Сборка потомства вирионов начинается на цитоплазматических вирусных фабриках, производя сферическую незрелую частицу. Эта вирусная частица созревает в внутриклеточный зрелый вирион в форме кирпича, который может высвобождаться при лизисе клеток или может приобретать вторую двойную мембрану из транс-Гольджи и зачатка в качестве внешних рецепторов-хозяев вириона, которые опосредуют эндоцитоз. Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина посредством микротрубочек наружу вирусного транспорта и существует в телах закупорки после гибели клетки и остается заразным, пока не найдет другого хозяина. Люди, позвоночные и членистоногие служат естественными хозяевами. Маршруты передачи: фомит, контакт и частицы в воздухе.
Род | Сведения о хозяине | Тропизм ткани | Сведения о входе | Сведения о выпуске | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Yatapoxvirus | Обезьяны; бабуины | нет | гликозаминогликаны | лизис; почкование | Цитоплазма | Цитоплазма | Контакт; насекомые |
Cervidpoxvirus | Олень | Нет | Гликозаминогликаны | Лизис; почкование | Цитоплазма | Цитоплазма | Неизвестно |
Лепорипоксвирус | зайцеобразный; белки | нет | гликозаминогликаны | лизис; почкование | цитоплазма | цитоплазма | членистоногие; связаться с |
Suipoxvirus | Swine | Нет | Гликозаминогликаны | Лизис; почкование | Цитоплазма | Цитоплазма | Неизвестно |
Моллюскипоксвирус | Человек | Нет | Гликозаминогликаны | лизис; почкование | Цитоплазма | Цитоплазма | Пол; контакт |
Crocodylidpoxvirus | Crocodiles | Нет | Гликозаминогликаны | Лизис; почкование | Цитоплазма | Цитоплазма | Неизвестно |
Каприпоксвирус | Овцы; козел; крупный рогатый скот | нет | гликозаминогликаны | лизис; почкование | цитоплазма | цитоплазма | членистоногие; контакт |
Ортопоксвирус | Люди; млекопитающие | нет | гликозаминогликаны | лизис; почкование | цитоплазма | цитоплазма | вирус натуральной оспы; Респираторный; контакт; зооноз |
авипоксвирус | Птицы | Нет | Гликозаминогликаны | Лизис; почкование | цитоплазма | цитоплазма | членистоногие; аэрозоль |
Парапоксвирус | Человек; млекопитающие | нет | гликозаминогликаны | лизис; почкование | цитоплазма | цитоплазма | зооноз; контакт |
Классификация в этом подсемействе основана на морфологии, типе нуклеиновой кислоты, способе репликации, организмах-хозяевах и типе вызываемого заболевания.
В этом подсемействе распознаются девять родов; кроме того, ряд видов еще не отнесен к роду.
Виды рода Avipoxvirus инфицируют птиц ; те, что принадлежат к родам поксвирусов каймана и крокодилипоксвирусов, заражают крокодилов.
Другие роды этого подсемейства инфицируют млекопитающих.
Известны следующие роды:
Последний общий предок ныне существующих поксвирусов, поражающих позвоночных, существовал 0,5 миллиона лет назад. Род Avipoxvirus отошел от своего предка 249 ± 69 тысяч лет назад. Предок рода Orthopoxvirus должен был отличиться от других клад 0,3 миллиона лет назад. Согласно второй оценке времени расхождения, это событие произошло 166 ± 43 000 лет назад. Разделение Orthopox на дошедшие до нас виды произошло около 14 000 лет назад. Род Leporipoxvirus возник около 137 ± 35 000 лет назад. Затем последовал предок рода Yatapoxvirus. Последний общий предок Capripoxvirus и Suipoxvirus разошелся 111 ± 29 000 лет назад.
Байесовское исследование геномов ортопоксии предполагает, что неклассифицированный поксвирус Йока произошел от линии, которая дала начало ортопоксвирусу примерно 90 000 лет назад. Ортопоксвирусы отделились от других вирусов оспы около 10 000 лет назад. Вирусы верблюжьей оспы, татерапии и натуральной оспы возникли 3500 лет назад, а вирус конской оспы - 3000 лет назад. Эти вирусы могли возникнуть в районе Африканского Рога.
Другое байесовское исследование предполагает, что натуральная оспа возникла около 3500 лет назад.