Войти
| Caulimoviridae | |
|---|---|
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Рибовирия |
| Королевство: | Pararnavirae |
| Тип: | Artverviricota |
| Класс: | Revtraviricetes |
| Отряд: | Ortervirales |
| Семейство: | Caulimoviridae |
Caulimoviridae представляет собой семейство вирусов, поражающих растения. В настоящее время это семейство насчитывает 85 видов, разделенных на 10 родов. Вирусы, принадлежащие к семейству Caulimoviridae, называются вирусами (или параретровирусами) с обратной транскрипцией с двухцепочечной ДНК (дцДНК), то есть вирусами, которые содержат обратную транскрипцию. стадия их репликационного цикла. Это семейство содержит все вирусы растений с геномом дцДНК, которые имеют фазу обратной транскрипции в своем жизненном цикле.
Следующие роды признаны :
Все вирусы этого семейства не имеют оболочки. Частицы вируса бывают бациллообразными или изометричными. Тип нуклеокапсида, включенного в структуру вируса, определяет размер вирусных частиц. Бацилловидные частицы имеют диаметр примерно 35–50 нм и длину до 900 нм. Изометрические частицы имеют в среднем 45–50 нм в диаметре и обладают икосаэдрической симметрией.
Геномная карта CaMV, хорошо изученного члена этого семейства. ORF: 1 - белок движения, 2 - фактор передачи тли, 3 - белок, связанный с вирионом, 4 - gag-капсид, 5 - про / pol- протеаза A3 и RT / РНКаза H, 6 - трансактиватор / вироплазмин. Среди этого семейства распространены MP, CP, PRO, POL. Расположение может быть разным. Геномы вирусов этого семейства содержат однораздельные, нековалентно замкнутые кольцевые дцДНК размером 7,2–9,3 т.п.н. с разрывами в обеих цепях генома в определенных местах. Эти геномы содержат от одной открытой рамки считывания (ORF), как наблюдается у петувирусов, до восьми ORF, таких как у соймовирусов. Белки, кодируемые вирусными геномами, включают обратную транскриптазу, -рибонуклеазу H, аспарагиновые протеазы, нуклеокапсиды и трансактиваторы - есть другие белки, необходимые для репликации, которым еще предстоит назначить конкретную функцию.
| Род | Структура | Симметрия | Капсид | Геномное расположение | Геномная сегментация |
|---|---|---|---|---|---|
| Росаднавирус | Икосаэдрический | T = 7 | Необолочечный | Круглый | Одночастный |
| Кавемовирус | Икосаэдрический | T = 7 | Без оболочки | Круглый | Одночастный |
| Петувирус | Икосаэдрический | T = 7 | Без оболочки | Циркулярный | Монодостаточный |
| каулимовирус | Икосаэдрический | T=7 | Без оболочки | Круглый | Одночастный |
| Соймовирус | Икосаэдрический | T=7 | Безоболочечный | Круглый | Однораздельный |
| Баднавирус | Бацилловидный | T=3 | Незоболочечный | Круглый | Монодостаточный |
| Солендовирус | Икосаэдрический | T = 7 | Без оболочки | Циркулярный | Одночастичный |
| Тунгровирус | Bacilliform | T = 3 | Без оболочки | Circular | Monopartite |
Репликация происходит как в цитоплазме, так и в ядре нас клеток-хозяев. Сначала вирусный геном попадает в цитоплазму. Вирусная ДНК образует суперспиральные структуры мини-хромосом при входе в ядро хозяина, где она транскрибируется в полиаденилированную РНК, которая является терминально избыточной (из-за того, что транскрипция происходит дважды для некоторых частей ДНК). Недавно транскрибируемая РНК попадает в цитоплазму, где она транслируется в вирусные белки или ретротранскрибируется в новые копии вирусного генома дцДНК с помощью вирусной обратной транскриптазы. Новые геномы дцДНК инкапсидируются в цитоплазму и высвобождаются.
Процесс репликации включает этап ретранскрипции и промежуточную РНК, поэтому вирусы из семейства Caulimoviridae не считаются настоящими вирусами дцДНК - вместо этого они называются ДНК-реверсивными -транскрипция вирусов. Они разделяют эту характеристику с ретровирусами. Однако, в отличие от ретровирусов, вирусы из семейства Caulimoviridae не требуют интеграции вирусного генома в геном их хозяев для репликации, и по этой причине их геном не кодирует ферментативный белок интеграза.
Наличие эндогенных вирусных элементов (ЭВЭ) в геномах растений широко распространено. и наиболее известные растительные EVE происходят от вирусов с ДНК-геномами семейства Caulimoviridae. Считается, что интеграция происходит за счет негомологичного соединения концов (незаконная рекомбинация) во время механизмов репарации ДНК. Большинство ЭВС растений не заразны. Тем не менее, инфекционные EVE Caulimoviridae были зарегистрированы в геноме петунии (вирус очищения жилок петунии ), банана (вирус OL с полосами бананов, вирус GF с полосами бананов, вирус с полосами IM) и Nicotiana edwardsonii (вирус, очищающий жилки табака).
| Род | Сведения о хосте | Тропизм ткани | Сайт репликации | Сайт сборки | Передача |
|---|---|---|---|---|---|
| Росаднавирус | Растения | Нет | Ядро | Цитоплазма | Тля |
| Кавемовирус | Растения | Нет | Ядро | Цитоплазма | Тля |
| Петувирус | Растения | Нет | Ядро | Цитоплазма | Прививка, активация инфекционных ЭВС |
| Каулимовирус | Растения | Нет | Ядро | Цитоплазма | Тля |
| Соймовирус | Растения | Нет | Ядро | Цитоплазма | Тля |
| Баднавирус | Растения | Нет | Ядро | Цитоплазма | Мучнистые червецы, активация инфекционных ЭВЭ |
| Солендовирус | Растения | Нет | Ядро | Цитоплазма | Активация инфекционных EVE |
| Тунгровирус | Растения | Нет | Ядро | Цитоплазма | Тля |
