Войти
| Катепсин E | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер EC | 3.4.23.34 | ||||||||
| Номер CAS | 110910-42-4 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Представление IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Запись BRENDA | ||||||||
| ExPASy | Представление NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Запись KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| PRIAM | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Катепсин E - это фермент (EC 3.4.23.34 ), который у человека кодируется CTSE ген. Фермент также известен как медленная протеиназа, аспарагиновая протеиназа мембраны эритроцитов, SMP, EMAP, непепсиновая протеиназа, катепсин D-подобная кислотная протеиназа, катепсин E-подобная кислотная протеиназа, катепсиновая протеиназа D-типа) является Фермент.
Катепсин E представляет собой протеазу, обнаруженную у животных, а также у различных других организмов, которая принадлежит к группе аспарагиновой протеазы. У человека он кодируется геном CTSE , расположенным в 1q32 на хромосоме 1. Это внутриклеточный нелизосомный гликопротеин, который в основном обнаруживается в коже и в иммунных клетках. Белок представляет собой аспартилпротеазу, которая функционирует как гомодимер с дисульфидной связью и имеет олигосахаридную цепь высокоманнозного типа. Он является членом семейства пептидаз A1 и, следовательно, обладает специфичностью, аналогичной специфичности пепсина A и катепсина D. Катепсин E является внутриклеточным ферментом и, по-видимому, не участвует в переваривании пищевых белков. В наибольшем количестве он обнаруживается на поверхности клеток эпителия желудка, производящей слизь. Это первая аспарагиновая протеаза, присутствующая в желудке плода, и она обнаруживается более чем в половине случаев рака желудка, в результате чего она оказывается онкофетальным антигеном. Для этого гена существуют варианты транскриптов, использующие альтернативные сигналы полиаденилирования и два варианта транскриптов, кодирующие разные изоформы.
Дефицит уровней катепсина E в организме может играть роль участвует в воспалительных кожных заболеваниях, таких как атопический дерматит, лечение которых будет зависеть от фиксации функциональности и уровней белка в организме. Наряду с ренином и катепсином D, катепсин E является одной из немногих аспарагиновых протеаз, которые, как известно, вырабатываются в тканях человека, кроме тканей желудочно-кишечного тракта и репродуктивного тракта.
структура катепсина E очень похожа на структуру катепсина D и BACE1, и все 3 имеют почти идентичные области активного сайта. Различия между ними заключаются в микросреде, окружающей их активные сайты. Остатки DTG 96-98 и DTG 281-283 способствуют образованию активного центра фермента. Также имеются две пары дисульфидных связей при остатках Cys 272-276 и Cys 314-351. Два других остатка Cys в положениях 109 и 114 аминокислотной цепи расположены близко друг к другу в трехмерном пространстве, однако расстояние между их атомами серы составляет 3,53 Å, что слишком велико для образования надлежащей дисульфидной связи. В структуре также есть четыре водородные связи между остатками Asp активного центра и окружающими остатками. Отличительный фактор катепсина E по сравнению со структурой катепсина D и BACE1 можно увидеть в образовании дополнительной водородной связи между остатками Asp 96 и Ser 99 и отсутствии водородной связи с Leu / Met в Asp 281.
Фермент распределяется в клетках желудочно-кишечного тракта, лимфоидной ткани, клетках крови, мочевых органах и микроглии. Его внутриклеточная локализация в различных клетках млекопитающих отличается от его аналога катепсина D. Катепсин E ассоциируется с мембранной тканью во внутриклеточных канальцах желудочных париетальных клеток, желчных каналах клеток печени, клетках риналя проксимальный каналец в почках, эпителиальные клетки в кишечнике, трахее и бронхах, остеокласты и даже в эритроцитах. Его локализацию в структурах эндосом можно увидеть во многих различных типах клеток, таких как антигенпрезентирующие В-клетки лимфобласты, клетки желудка и микроглия. Его присутствие также обнаруживается в цистернах эндоплазматического ретикулума клетки.
Катепсин E играет жизненно важную роль в деградации белка, процессинг антигена через MHC путь класса II и образование биоактивного белка. Считается также, что фермент участвует в реализации пути смерти нейронов, вызванной возрастом, а также в чрезмерной стимуляции рецепторов глутамата эксайтотоксинами и преходящей ишемии переднего мозга . В эксперименте, проведенном на крысах, катепсин Е практически не обнаруживался в тканях мозга молодых крыс, однако у старых крыс его уровень был значительно повышен в неостриатуме и коре головного мозга. Фермент также экспрессировался на высоких уровнях в активированной микроглии области CA1 гиппокампа и в дегенерирующих нейронах в течение недели после временной ишемии переднего мозга. Катепсин E может играть роль в развитии хорошо дифференцированной аденокарциномы из кишечной метаплазии. Фермент также играет роль в ассоциации с дендритными клетками, где он генерирует репертуар CD4 в ответ на собственные и чужеродные белки.
Фермент гликозилирован. Различные типы клеток способствуют различию в природе углеводной цепи. В проферменте фибробластов наблюдается олигосахарид с высоким содержанием маннозы, однако зрелый фермент можно увидеть с олигосахаридом сложного типа. В мембранах эритроцитов зрелый фермент и профермент содержат олигосахариды сложного типа. Автокаталитическое расщепление дает две формы фермента: Форма 1 начинается с остатка Ile 54, а Форма 2 - с Thr 57.
