Дисульфид-гидролаза | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Номер ЕС | 3.13.1.5 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
IntEnz | IntEnz view | ||||||||
BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
KEGG | KEGG entry | ||||||||
MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
PRIAM | профиль | ||||||||
PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
|
Идентификаторы | |
---|---|
Символ | ? |
SCOPe | 1can / SUPFAM |
Дисульфидгидролаза - фермент с молекулярная масса 23 576 Да. Фермент гексадекамерный. Он катализирует гидролиз сероуглерода.
Дисульфид углерода естественным образом встречается в грязевых ваннах вулканических сольфатар. Это предшественник сероводорода, который является донором электронов. Было обнаружено, что гипертермофильный штамм Acidianus превращает CS 2 в H 2 S и CO 2.
. Фермент подобен ферменту углеангидраз. Ферментный мономер гидролазы CS 2 проявляет типичную β-карбоангидразную складку и активный сайт. Два из этих мономеров образуют тесно переплетенный димер с центральным β-слоем, покрытым α-спиральным доменом. Четыре димера образуют квадратное октамерное кольцо за счет взаимодействия длинных плеч на N- и C-концах. Подобные кольцевые структуры наблюдались в штаммах карбоангидраз, однако в CS 2 гидролаза представляет собой фермент, состоящий из двух октамерных колец, образующих гексадекамер, блокирующихся под прямым углом друг к другу. Это приводит к блокированию входа в активный центр и образованию единственного высокогидрофобного туннеля длиной 15 Å, который функционирует как фильтр специфичности. Это обеспечивает ключевое различие между карбоангидразой и гидролазой CS 2. Этот туннель определяет субстратную специфичность фермента для CS 2, который также является гидрофобным.
Эта гидролаза превращает CS 2 в H 2 S. Процесс аналогичен гидратации CO 2 карбоангидразой. Это сходство указывает на вероятный механизм. Цинк в активном центре является тетраэдрическим и координируется Cys 35, His 88, Cys 91 и водой. Воду депротонируют с получением гидроксида цинка, который добавляет субстрат, чтобы получить промежуточное соединение Zn-O-C (S) SH. Аналогичный процесс предлагается для преобразования COS в CO2.
Форма апофермента, лишенная кофактора цинка, имеет молекулярную массу 382815,4 г / моль. Ион хлорида и 3,6,9,12,15,18,21,24,27,30,33,36,39-тридекаоксагентетраконтан-1,41-диол (C28H58O15) являются двумя основными лигандами, присутствующими в ферменте. в таком виде. В этой форме видны 16 полимерных цепей, которые вносят вклад в тяжелость фермента. Эту форму также иногда называют формой селенометионина.