CUL4B

редактировать
CUL4B
Белок CUL4B PDB 2do7.png
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы CUL4B, CUL-4B, MRXHF2, MRXS15, MRXSC, SFM2, cullin 4B
Внешние идентификаторыOMIM: 300304 MGI: 1919834 HomoloGene : 2660 Генные карты : CUL4B
Расположение гена (человек)
Х-хромосома (человека)
Chr. Х-хромосома (человек)
Х-хромосома (человека) Геномный местоположение для CUL4B Геномный местоположение для CUL4B
Полоса Xq24Начало120,524,612 bp
Конец120,575,794 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CUL4B 210257 x at fs.png .. PBB GE CUL4B 202213 s на fs.png .. PBB GE CUL4B 202214 s на fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

8450

72584

Ensembl

ENSG00000158290

ENSMUSG00000031095

UniProt

Q13620

A2A432

RefSeq (мРНК)

NM_001079872. NM_003588. NM_001330624. NM_001369145

NM_001110142. NM_028288

RefSeq (протеин)

NP_001073341. NP_001317553. NP_00_007002135123 NP_082564

Местоположение (UCSC)Chr X: 120,52 - 120,58 Мб нет данных
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Cullin-4B представляет собой белок , который у человека кодируется геном CUL4B , который расположен на Х-хромосоме. CUL4B имеет высокое сходство последовательностей с CUL4A, с которым он разделяет определенные функции E3 убиквитинлигазы. CUL4B в значительной степени экспрессируется в ядре и регулирует несколько ключевых функций, включая: клеточный цикл прогрессирование, ремоделирование хроматина и неврологическое и плацентарное развитие у мышей. У людей CUL4B был вовлечен в Х-связанную умственную отсталость и часто мутировал в аденокарциноме поджелудочной железы и в небольшом проценте различных видов рака легких. Вирусы, такие как ВИЧ, также могут кооптировать комплексы на основе CUL4B, чтобы способствовать вирусному патогенезу. Комплексы CUL4B, содержащие цереблон, также являются мишенью тератогенного препарата талидомид.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Функции
    • 2.1 Регуляция клеточного цикла и ремоделирование хроматина
    • 2.2 Млекопитающие эмбриональное развитие
    • 2.3 Неврологическое развитие
  • 3 Клиническая значимость
    • 3.1 Х-связанная умственная отсталость
    • 3.2 Вирусный патогенез
    • 3.3 Рак
    • 3.4 Лечение талидомидом
  • 4 Взаимодействия и субстраты
  • 5 Примечания
  • 6 Ссылки
  • 7 Внешние ссылки
  • 8 Дополнительная литература
Структура

CUL4B человека состоит из 913 аминокислот и имеет высокую степень идентичности последовательностей (84%) с CUL4A за исключением его уникальной N-концевой области. Крайний N-конец CUL4B неупорядочен, и в настоящее время неясно, какими структурными и функциональными качествами он обладает. CUL4B связывается с бета-пропеллером адапторного белка DDB1, который взаимодействует с многочисленными факторами, ассоциированными с DDB1-CUL4 (DCAF). Это взаимодействие является решающим для рекрутирования субстратов в комплекс убиквитин-лигазы. На С-конце CUL4B взаимодействует с белком RBX1 / ROC1 через его домен RING. RBX1 является основным компонентом комплексов убиквитин-лигаза Cullin-RING (CRL) и выполняет функцию рекрутирования ферментов, конъюгирующих с убиквитином E2. Следовательно, C-конец CUL4B - вместе с RBX1 и активированными ферментами E2 - составляет каталитическое ядро ​​комплексов CRL4B. CUL4B также модифицируется путем ковалентного присоединения молекулы NEDD8 к высококонсервативному остатку лизина в С-концевой области. Эта модификация, по-видимому, вызывает конформационные изменения, которые способствуют гибкости домена RING белков кулина и повышают активность убиквитинлигазы.

Функции

Регуляция клеточного цикла и ремоделирование хроматина

CUL4B- Комплексы убиквитинлигазы на основе E3 часто демонстрируют перекрывающуюся активность с комплексами на основе CUL4A. Оба комплекса CRL4 используют Cdt2 и фактор ДНК процессивности PCNA для индукции убиквитинирования и деградации репликации фактора лицензирования Cdt1 и циклин-зависимых ингибитор киназы p21 протеасомным -зависимым образом. CRL4 также разрушает связанный с PCNA PR-Set7 / SET8, который представляет собой гистон-4-метилтрансферазу, и субъединицу p12 ДНК-полимеразы δ, которая имеет решающее значение для репликации ДНК. В результате комплексы CRL4 способны контролировать начало репликации ДНК, ремоделирование хроматина и прохождение клеточного цикла.

Эмбриональное развитие млекопитающих

Потеря Cul4b у мышей вызывает эмбриональную летальность и дефекты плацентарного развития. Внеэмбриональная ткань этих развивающихся мышей также показала повышенную скорость апоптоза и снижение клеточной пролиферации. Когда делеция Cul4b была ограничена эпибластом (только в Sox2 -экспрессирующей ткани), можно было получить живых мышей.

Неврологическое развитие

Мыши, которые не экспрессируют CUL4B в ткани эпибласта, демонстрируют нормальную морфологию мозга, но снижают количество парвальбумин (PV) -положительных ГАМКергических интернейронов, особенно в зубчатой ​​извилине. У этих мышей определенные дендритные особенности нейронов гиппокампа также были затронуты потерей Cul4b, что может объяснить наблюдаемое увеличение эпилептической восприимчивости и пространственных дефектов обучения. Эти фенотипы напоминали особенности, наблюдаемые у пациентов с Х-связанной интеллектуальной инвалидностью (см. Ниже).

Клиническая значимость

Х-связанная умственная отсталость

Случаи потери функции мутации CUL4B были обнаружены у многих пациентов с Х-связанной умственной отсталостью, для которого характерны агрессивные вспышки, судороги, относительная макроцефалия, центральное ожирение, гипогонадизм, pes cavus и тремор. Мутации CUL4B также были связаны с пороками развития коры головного мозга.

Вирусный патогенез

После того, как ВИЧ заражает клетку, вирус «захватывает» либо комплекс CUL4B-DDB1, либо CUL4A- DDB1 комплекс через тот же механизм. По сути, белки ВИЧ, такие как Vpr и Vpx, связываются с VPRBP (DDB1-связывающий субстратный рецепторный белок) и вызывают убиквитинирование и деградацию SAMHD1. и UNG2 для стимуляции репликации вируса. Эти белки не расщепляются комплексами CRL4 в отсутствие вируса.

Рак

Согласно данным из Атласа генома рака, CUL4B мутирован в 21% карцином поджелудочной железы с повторяющейся усекающей мутацией в аминокислоте 143. CUL4B также является мутировавший или усиленный в 3-5% случаев рака легких. Значение этих наблюдаемых мутаций не определено.

Лечение талидомидом

В 2010 году Ito et al. сообщили, что Cereblon, белок DCAF, был основной мишенью тератогенного соединения талидомида. Талидомид и другие производные, такие как помалидомид и леналидомид, известны как иммуномодулирующие препараты (или IMiD) и были исследованы в качестве терапевтических агентов при аутоиммунных заболеваниях и некоторых видах рака. особенно миеломы. Недавние отчеты показывают, что IMiD связываются с CRL4 и способствуют деградации факторов транскрипции IKZN1 и IKZN3, которые обычно не являются мишенью для комплексов CRL4.

Взаимодействия и субстраты

CUL4B человека образует прямые взаимодействия с:

Комплексы CUL4B-DDB1-RBX1 человека способствуют убиквитинированию:

Белок является субстратом CRL4, только если направляется вирусными белками. белок является субстратом CRL4 только когда направляется IMiDs

Примечания

Ссылки
Внешние ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-05-13 12:28:18
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте