Са / кальмодулин-зависимая протеинкиназа | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Номер EC | 2.7.11.17 | ||||||||
Номер CAS | 97350-82-8 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
IntEnz | Представление IntEnz | ||||||||
BRENDA | Запись BRENDA | ||||||||
ExPASy | Представление NiceZyme | ||||||||
KEGG | Запись KEGG | ||||||||
MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
PRIAM | профиль | ||||||||
PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Онтология гена | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
CAMK, также записывается как CaMK представляет собой аббревиатуру для класса ферментов Са / кальмодулин-зависимая протеинкиназа . CAMK активируются увеличением концентрации внутриклеточных ионов кальция (Ca) и кальмодулина. При активации ферменты переносят фосфаты от АТФ к определенным остаткам серина или треонина в других белках, поэтому они являются серин / треонин-специфическими протеинкиназами.. Активированный САМК участвует в фосфорилировании факторов транскрипции и, следовательно, в регуляции экспрессии отвечающих генов. CAMK также работает, чтобы регулировать жизненный цикл клетки (то есть запрограммированную смерть клетки), перестройку цитоскелетной сети клетки и механизмы, участвующие в обучении и памяти организма.
Существуют 2 общих типа белков САМ-киназы: специализированные и многофункциональные САМ-киназы.
После того, как кальций концентрации в клетке повышаются, CAM-киназы насыщаются и связывают максимум четыре молекулы кальция. Это насыщение кальцием активирует киназу и позволяет ей претерпевать конформационные изменения, которые позволяют киназе связываться с ее сайтами-мишенями фосфорилирования. CAMK удаляет фосфатную группу из АТФ, чаще всего с использованием иона Mg, и добавляет ее к белку CAM, делая его активным. CAM-киназа содержит высококонцентрированную глициновую петлю, где гамма-фосфат из донорной молекулы АТФ легко может связываться с ферментом, который затем использует ион металла для облегчения плавного переноса фосфата к целевому белку. Этот перенос фосфата затем активирует мишень киназы и завершает цикл фосфорилирования.
На Рисунке 1 показано, как присутствие кальция или кальмодулина позволяет активировать CAM-киназы (CAMK II).
Рисунок 2: Графическая иллюстрация неочищенных доменов кальций / кальмодулин-зависимой протеинкиназы 1Все киназы имеют общую структуру каталитического ядра, включая сайт связывания АТФ вместе с большим сайтом связывания субстрата. Каталитическое ядро обычно состоит из β-цепей, а сайт связывания субстрата состоит из α-спиралей. Большинство киназ CAM включает в себя множество доменов, в том числе: каталитический домен, регуляторный домен, ассоциативный домен и домен связывания кальция / кальмодулина.
CAMK I, как показано на рисунке 2, имеет двойной -дольчатая структура, состоящая из каталитического, субстрат-связывающего домена и аутоингибиторного домена. Для того, чтобы аутоингибиторный домен стал функциональным, он должен заставить белок соответствовать таким образом, чтобы этот домен полностью блокировал домен субстрата от захвата новых мишеней. На рисунке 2 подробно показаны структура и домены CAMK I.
CAMK II имеет множество различных форм, из которых CAMK 2A является наиболее распространенной, как показано на рисунке 3. CAMK 2A имеет кольцевую форму. кристаллическая структура, состоящая из более мелких функциональных групп. Эти группы допускают CaM-зависимое фосфорилирование мишеней, но также позволяют структуре автофосфорилироваться и становиться CaM-независимой, как показано на рисунке 1. Это означает, что как только белок CAMK 2A первоначально активируется кальцием или кальмодулином, он может: в свою очередь, дополнительно активируется, поэтому он не становится неактивным даже без кальция или кальмодулина.
Рисунок 3: Изображение CAMK 2A, который представляет собой форму кальций / кальмодулин-зависимой киназы в ее кристаллической форме.Члены класса ферментов CAMK включают, но являются не ограничиваясь:
Псевдокиназы - это псевдоферменты, белки, которые похожи по структуре на ферменты, но не обладают каталитической активностью.
Некоторые из этих псевдокиназ, связанных с CAMK Семейство включает: