Инвинсибл Одиннадцать ушли.. CAF приказал сыграть вничью на одном этапе в Киншасе из-за гражданской войны в Чаде, но Renaissance FC возражали против этого решения; они были исключены из соревнований, оштрафованы на 4000 долларов и отстранены от соревнований CAF на три года.. Tusker FC были исключены из соревнований и оштрафованы на 5000 долларов после того, как кенийские иммиграционные власти отказали назначенным официальным лицам матча на въезд в страну на первом этапе.. Wallidan FC и FC Civics отказались от участия до проведения жеребьевки.. Примечание: клубы из Центральноафриканской Республики, Кении, Либерия и Сьерра-Леоне были дисквалифицированы за невыполнение своих финансовых обязательств, а клубы из Сомали, Джибути, Сан-Томе и Принсипи и Малави были дисквалифицированы тремя месяцами ранее.
Первый раунд
Матчи первых матчей 1/16 финала были сыграны 21–23 Марш и ответные матчи были сыграны 4–6 апреля 2008 года.