CA1 (ген)

редактировать
CA1
Белок CA1 PDB 1azm.png
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы CA1, CA-I, CAB, Car1, HEL-S-11, карбоангидраза 1
Внешние идентификаторыOMIM: 114800 MGI: 88268 HomoloGene: 20414 GeneCards: CA1
Местоположение гена (человек)
Хромосома 8 (человека)
Chr. Хромосома 8 (человек)
Хромосома 8 (человека) Расположение генома для CA1 Расположение генома для CA1
Band 8q21.2Start85,327,608 bp
Конец85,379,014 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CA1 205950 s at fs.png .. PBB GE CA1 205949 в fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

759

12346

Ensembl

ENSG00000133742

ENSMUSG00000027556 ​​

UniProt

P00915

P136 NM34

RefSeq (mRNA)

NM_001083957. NM_009799

RefSeq (протеин)

NP_001077426. NP_033929

Местоположение (UCSC)Chr 8: 85,33 - 85,38 Мб Chr 3: 14,77 - 14,81 Мб PubMed>поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Карбоангидраза 1 - это фермент, который у человека кодируется геном CA1 .

Карбоангидразы (СА) представляют собой большое семейство металлоферментов цинка, которые катализируют обратимую гидратацию диоксида углерода. Они участвуют во множестве биологических процессов, включая клеточное дыхание, кальцификацию, кислотно-щелочной баланс, резорбцию костей и образование водянистой влаги, спинномозговой жидкости, слюна и желудочная кислота.

Они демонстрируют большое разнообразие в распределении тканей и их субклеточной локализации. CA1 тесно связан с генами CA2 и CA3 на хромосоме 8, и он кодирует цитозольный белок, который находится на самом высоком уровне в эритроцитах. Варианты транскриптов CA1, использующие альтернативные полиА_сайты, описаны в литературе.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Механизм
  • 3 Функция
  • 4 Клиническая значимость
  • 5 Взаимодействия
  • 6 Ссылки
  • 7 Внешние ссылки
  • 8 Дополнительная литература
Структура

Белок СА1 человека содержит N-конец активный сайт, сайт связывания цинка и субстрат -обвязка сайта. Кристаллическая структура человеческого комплекса CA1- бикарбонат демонстрирует геометрию двух H-связей между Glu 106- Thr 199 и пара Glu117- His 119 и одна пи-Н-связь между молекулой воды и фенильным кольцом Tyr 114 остатков. ингибирование продукта CA1 посредством бикарбонатных анионов коррелирует с изменением локализации протона на His119. Таким образом, считается, что H-связь Glu117-His119 регулирует ионность иона цинка и силу связывания бикарбонат-аниона.

Механизм

Реакция, катализируемая CA1, такая же, как и другие белки семейства карбоангидразы:

CO 2 + H 2 O → Карбоангидраза H 2 CO 3 {\ displaystyle {\ ce {{CO2} + H2O ->[{} \ atop {\ ce {Carbonic ~ anhydrase}}] H2CO3}}}{\displaystyle {\ce {{CO2}+H2O->[{} \ atop {\ ce {Carbonic ~ anhydrase}}] H2CO3}}}

тканях - высокая концентрация CO 2)

Катализируемая CA1 реакция имеет относительно низкое сродство к реакции (Km) 4,0 мМ для CO 2,числа оборотов (Kcat) 2 × 10 с и каталитической эффективности (Kcat / Км) из 5 × 10 Ms по сравнению с другими изоферментами семейства α-CA карбоангидраз. Скорость оборота и каталитическая скорость CA1 составляют лишь около 10% от CA2 (Kcat: 1,4 × 10 с, Kcat / км: 1,5 × 10 Ms).

Функция

Карбоангидраза 1 принадлежит к подсемейству α-CA и локализуется в цитозоле эритроцит, желудочно-кишечный тракт, сердечная ткань и другие органы или ткани. Трансмембранный транспорт бикарбоната, продуцируемого СА, вносит значительный вклад в клеточную регуляцию pH.

В активированном цинком варианте СА1 человека, Мичиганский вариант, единственный точечная мутация изменяет His 67 на Arg в критической области активного сайта. Этот вариант металлофермента цинка , по-видимому, уникален тем, что он обладает активностью эстеразы, которая специфически усиливается добавлением свободных ионов цинка.

Клиническая значимость

активация CA1 связана с ухудшением патологического ремоделирования у человека ишемической диабетической кардиомиопатией. У пациентов с сахарным диабетом 2 типа с постинфарктной сердечной недостаточностью, перенесших хирургическую коронарную реваскуляризацию, уровни CA1 в миокарде были в шесть раз выше, чем у пациентов без диабета. Повышенная экспрессия CA1 в основном локализовалась в клетках сердечного интерстиция и эндотелиальных клетках. Кроме того, высокое индуцированное глюкозой повышение уровня СА1 препятствует проницаемости эндотелиальных клеток и определяет апоптоз эндотелиальных клеток in vitro.

CA1 также опосредует геморрагический проницаемость сетчатки и сосудов головного мозга за счет активации прекалликреина и генерации фактора XIIa сериновой протеазы. Эти явления вызывают прогрессирование пролиферативной диабетической ретинопатии и диабетического отека макулы, которые представляют собой основные причины потери зрения.

Поскольку CA1 является важной терапевтической мишенью, развитие его ингибиторы будут способствовать лечению болезни. По сравнению с другими членами семейства СА, СА1 имеет относительно низкое сродство к обычным ингибиторам СА. Тем не менее, он имеет среднее сродство к ингибитору CA сульфонамидам.

Взаимодействия

Было показано, что CA1 взаимодействует с:

Эти взаимодействия были подтверждено с использованием высокопроизводительного метода (одно обращение)

Ссылки
Внешние ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-05-13 09:57:18
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте