В 2006 году, после того, как обвинения были предъявлены ряду заключенных, содержащихся в изоляторе Гуантанамо. лагерей, бойкот судебных слушаний был объявлен Али аль-Бахлулом. Бойкот набрал силу в 2008 году, когда все больше заключенных столкнулись с военными комиссиями Гуантанамо
Бойкот поставил под угрозу будущее трибуналов и снизил доверие к Закону о военных комиссиях 2006 года по мере того, как заключенные приняли решение не сотрудничать и не признавать судебное разбирательство американских военных на фоне утверждений о том, что суды не были беспристрастными, задержанные подвергались жестокому обращению или пыткам, заставляя их давать ложные признания, и признали бы каждого задержанного «виновным» независимо от фактов. После начала бойкотов уверенность общества в справедливости судебных процессов упала до рекордно низкого уровня.
Американские военные прокуроры, организованные самими задержанными, обвинили давление со стороны сверстников в том, что они убедили других заключенных присоединиться
Шесть обвиняемых предстали перед судьей в 2008 году, и пятеро из них заявили о своем намерении бойкотировать судебное разбирательство. Канадец Омар Хадр, обвиненный в бросании гранаты, когда ему было 15 лет, является единственным задержанным, которому предъявлены обвинения, который в настоящее время не бойкотирует слушания, поскольку его адвокаты подчеркнули, что это показывает, что он не представляет угрозы. и будет "играть по правилам", если его выпустят. Однако он был бывшим участником бойкота, объявив о своем намерении бойкотировать в марте 2006 года.