Тип | Открытая компания |
---|---|
Промышленность | Секвенирование генома. Биотехнология |
Основана | 9 сентября 1999 г. (Пекин) |
Основатель | Ван Цзянь. Ю Цзюнь. Ян Хуаньмин. Лю Сыци |
Штаб-квартира | Шэньчжэнь, Гуандун, Китай |
Количество населенных пунктов | |
Обслуживаемая территория | По всему миру |
Ключевые люди | Ван Цзянь (президент, председатель) |
Продукты | Платформа DNBseq ™ (платформа для секвенирования нового поколения), Тест NIFTY® (неинвазивный пренатальный тест) |
Бренды | DNBseq ™, NIFTY® |
Выручка | 251 миллион долларов (2016) |
Чистая прибыль | 51,7 миллиона долларов (2016) |
Владелец | Ван Цзянь |
Количество сотрудников | ~ 6000 (по всему миру) |
Подразделения | BGI China (материк). BGI Asia Pacific. BGI Americas. BGI Europe (Европа и Африка) |
Дочерние компании | Список дочерних компаний:
|
Веб-сайт | www. bgi.com/global/. www.genomics.cn |
BGI, в настоящее время известная как BGI Group, ранее известная как Пекинский институт геномики, является китайская компания по секвенированию генома со штаб-квартирой в Шэньчжэнь, Гуандун, Китай.
Она была создана в 1999 году для участия в Human Genome Project как центр генетических исследований. Он также секвенирует геномы других животных, растений и микроорганизмов.
BGI Group объявила на конференции AGBT в феврале 2020 года, что сделает секвенирование генома дешевле, впервые преодолев 100-долларовый барьер. Компания из Шэньчжэня заявляет, что низкая стоимость станет возможной благодаря «экстремальной» системе секвенирования ДНК, которую она планирует предложить, которая способна расшифровывать геномы 100 000 человек в год.
Компания превратилась из научно-исследовательского института, который расшифровывал ДНК панд и растений риса, в компанию, занимающуюся клонированием животных, тестированием здоровья и исследованиями по контрактам.
Ван Цзянь, Ю Цзюнь Ян Хуаньмин и Лю Сици создали BGI в сентябре 1999 года в Пекине, Китай, в качестве неправительственной организации. независимый исследовательский институт т.е. для участия в Проекте генома человека в качестве представителя Китая. После завершения проекта финансирование прекратилось, после чего BGI переехала в Ханчжоу в обмен на финансирование от муниципального правительства Ханчжоу. В 2002 году BGI секвенировала геном риса, о чем писали на обложке журнала Science. В 2003 году BGI расшифровала геном вируса SARS и создала набор для обнаружения вируса. В 2003 году BGI Ханчжоу и Университет Чжэцзян основали новый исследовательский институт Институт геномных наук им. Джеймса Д. Уотсона при Чжэцзянском университете. Институт Уотсона должен был стать крупным центром исследований и образования в Восточной Азии по образцу лаборатории Колд-Спринг-Харбор в США.
В 2007 году штаб-квартира BGI переехала в Шэньчжэнь как «первое управляемое гражданами некоммерческое исследовательское учреждение в Китае». Ю Цзюнь покинул BGI в это время, якобы продав свою долю другим трем учредителям за символическую сумму. В 2008 году правительство Шэньчжэня официально признало BGI-Shenzhen некоммерческой организацией. В 2008 году BGI опубликовала первый геном человека из Азии.
В 2010 году BGI Shenzhen был сертифицирован как отвечающий требованиям стандарта ISO9001: 2008 для разработки и предоставления услуг высокопроизводительного секвенирования. В том же году BGI приобрела 128 машин для секвенирования генов Illumina HiSeq 2000, на которые в течение следующих 10 лет было выделено 1,5 миллиарда долларов США в виде «фондов сотрудничества» от China Development Bank. По сообщениям, к концу года их бюджет составлял 30 миллионов долларов. В 2010 году была основана компания BGI Americas с главным офисом в Кембридже, Массачусетс, США, а BGI Europe была основана в Копенгагене, Дания. К 2018 году они были расширены за счет офисов и лабораторий в Сиэтле и Сан-Хосе в США и Лондоне в Великобритании, а также были основаны BGI Asia Pacific с офисы в Гонконге, Кобе (Япония), Бангкоке (Таиланд), Лаосе, Сингапуре, Брисбен (Австралия) и многие другие.
В 2011 году компания BGI сообщила, что в ней работает 4000 ученых и технических специалистов, а ее доход составляет 192 миллиона долларов. BGI провела секвенирование генома смертоносной 2011 г., Германия E. coli O104: вспышка H4 за три дня и выпустила его по открытой лицензии. С 2012 года он начал коммерциализацию своих услуг, имея инвестиции от China Life Insurance Company, Citic's Goldstone Investment, Yunfeng Capital Джека Ма и SoftBank China Capital. В том же году они запустили собственный научный журнал GigaScience в партнерстве с BioMed Central для публикации статей по науке о жизни с большим объемом данных. В 2013 году BGI сообщила, что поддерживает отношения с 17 из 20 ведущих мировых фармацевтических компаний, и сообщила, что предоставляет глобальным фармацевтическим компаниям услуги в области коммерческой науки, здравоохранения, сельского хозяйства и информатики. В том же году она купила Complete Genomics у Mountain View, California, крупного поставщика технологии секвенирования ДНК, за 118 миллионов долларов США. В том же году BGI был оценен примерно в 820 миллионов долларов.
В 2015 году они подписали договор о сотрудничестве с больницей Чжуншань Центром точной клинической медицины в Шанхае, открытым в мае 2015 года. с бюджетом 100 миллионов йен. Сообщается, что они участвуют в качестве института секвенирования в китайском исследовательском проекте медицинского обслуживания стоимостью 9,2 миллиарда долларов, который продлится 15 лет. В мае 2017 года было объявлено о создании инновационного центра Западного побережья, совмещенного в Сиэтле и Сан-Хосе, на первом месте, где планируется работать над точной медициной и налажено сотрудничество с Вашингтонским университетом, Институт исследований мозга Аллена, Фонд Билла и Мелинды Гейтс и Вашингтонский государственный университет, а во второй уже существующей лаборатории со 100 сотрудниками для разработки следующей -генерационное секвенирование технологий. В мае 2018 года было достигнуто соглашение с больницей Mount Sinai (Торонто), Канада, о первой установке платформ BGISEQ в Северной Америке.
BGI Genomics, дочерняя компания BGI Group, сделала первичное публичное размещение акций в июле 2017 года на Шэньчжэньской фондовой бирже, собрав 547 миллионов йен (80,7 миллиона долларов), при этом оценка компании в первый день составила более 1,15 миллиарда долларов. Согласно сообщениям, в 2018 году 85,3% BGI принадлежало Ван Цзяню, а группе принадлежало 42,4% ее основного подразделения BGI Genomics. Заявленная рыночная стоимость BGI Genomics в июле 2018 года составила около 5 миллиардов долларов, как и другая дочерняя компания, MGI Tech, специализирующаяся на разработке и производстве технологий, IPO которой около 20% акций за 1 миллиард долларов запланировано на 2019 год в Гонконге.. В 2019 году конкурент Illumina, Inc. подал несколько исков о нарушении патентных прав против BGI.
В 2019 году сообщалось, что дочерняя компания BGI, Forensic Genomics International, предъявила создали базу данных генетических профилей людей по всей стране с поддержкой WeChat. В июле 2020 года сообщалось, что BGI вернула ссуду Paycheck Protection Program после проверки СМИ. В том же месяце Бюро промышленности и безопасности включило две дочерние компании BGI в свой «Список организаций» за помощь в предполагаемых нарушениях прав человека в связи с его работой по генетическому анализу в Синьцзяне.
Международный проект, начатый в 1990 году и объявленный завершенным в 2003 году. Они присоединились к ним в 1999 году и обеспечили 1% рабочей нагрузки.
Международный проект, запущенный в 2002 году и объявленный завершенным в 2009 году. Они обеспечили 10% рабочей нагрузки.
Начался в 2007 году и назван в честь двух Считается, что императоры основали доминирующую этническую группу Китая, BGI планировали в этом проекте, чтобы секвенировать по крайней мере 100 китайцев, чтобы создать карту китайских генетических полиморфизмов с высоким разрешением. Первые данные о геноме были опубликованы в октябре 2007 года. Анонимный китайский миллиардер пожертвовал проекту 10 миллионов юаней (около 1,4 миллиона долларов США), и его геном был секвенирован в начале проекта.
Международный проект, запущенный в 2008 году и объявленный завершенным в 2015 году.
Международный проект, запущенный в 2008 году.
Международный проект, инициированный совместно с Детской больницей Филадельфии в 2011 году. С его помощью были обнаружены гены и мутации, связанные с редкими заболеваниями, о которых сообщалось в более чем 20 научных публикациях. Они также «участвовали в разработке клинического диагностического теста всего экзома, предлагаемого с 2012 года при патологии CHOP». Они снова начали сотрудничать в 2017 году, когда к Консорциуму детских опухолевых тканей головного мозга CHOP присоединился Китайский национальный генетический банк.
. Китайский проект был сосредоточен на исследовании генетической основы интеллекта запущен в августе 2012 года. Американский физик Стивен Хсу присоединился в качестве научного консультанта и был одним из руководителей проекта. Это было сделано на 2200 выборках, в основном из Соединенных Штатов, из которых 1600 были индивидуумами, которые участвовали в исследовании математически недоразвитой молодежи и, как сообщается, имели IQ более 160, собранные американцами. психолог и генетик Роберт Пломин.
Международный проект, запущенный в 2008 году и объявленный завершенным в 2015 году. В 2010 году BGI объявил о своем завершении внести 100 миллионов долларов США в крупномасштабные проекты по секвенированию растений и животных.
В 2009 году BGI-Shenzhen объявил о запуске трех геномных проектов, направленных на животных живущие в экстремальных условиях. Три выбранных генома принадлежат двум полярным животным: полярному медведю и императорскому пингвину и одному альтиплано животному: Тибетская антилопа.
В 2010 г., BGI, Пекинский университет, Хэйлунцзян Маньчжурский тигровый лесной зоопарк, Институт зоологии Куньмина, Зоопарк Сан-Диего Калифорнийский институт природоохранных исследований и другие организации объявили, что будут высекать амурского тигра, южно-китайского тигра, бенгальского тигра, азиатский лев, африканский лев, дымчатый леопард, снежный барс и другие представители семейства кошачьих. BGI также будет секвенировать геномы и эпигеномы лигера и тигона. Поскольку два реципрокных гибрида имеют разные фенотипы, несмотря на то, что они генетически идентичны, ожидалось, что эпигеном может выявить основу таких различий. Цель проекта заключалась в том, чтобы значительно продвинуть исследования по охране природы, и он был благоприятно объявлен китайским годом Тигра. В 2013 году были опубликованы результаты по геномам тигра анур, белого бенгальского тигра, африканского льва, белого африканского льва и снежного барса.
Совместно финансируемый проект, объявленный 19 марта 2010 года, BGI объявил, что будет сотрудничать с Сидни К. Пирсом из Университета Южной Флориды и Чарльзом Делвишем из Университета Мэриленда в Колледж-Парке для секвенирования геномов морского слизня. Elysia chlorotica и пища для него водорослей Vaucheria litorea. Морской слизень использует гены водорослей для синтеза хлорофилла, первого обнаруженного межвидового переноса генов. Секвенирование их геномов может выяснить механизм этого переноса. Эта работа была в конечном итоге завершена, и была представлена сборка генома общей длиной 557 МБ.
Международный проект, инициированный Смитсоновским институтом и другими партнерами в 2018, чтобы секвенировать ДНК 1,5 миллиона известных видов эукариот на планете.
Проект был начат 1 августа 2009 г. миссия по секвенированию 10 000 микробов в течение 3 лет. Он включает секвенирование промышленных, сельскохозяйственных, медицинских микроорганизмов и многие другие. Это делается в сотрудничестве со многими институтами, университетами и предприятиями, включая Исследовательский институт биотехнологии Китайской академии сельскохозяйственных наук и Тяньцзиньский институт промышленной биотехнологии Китайской академии наук.
В 2010 году институтский суперкомпьютер с 500 узлами обрабатывал 10 терабайт необработанных данных секвенирования каждые 24 часа с имеющихся 30 или около того анализаторов генома от Illumina. Годовой бюджет компьютерного центра составлял 9 миллионов долларов США. В том же году вычислительные биологи BGI разработали первый успешный алгоритм, основанный на теории графов, для выравнивания миллиардов строк из 25-75 пар оснований, созданных секвенсорами следующего поколения, в частности Illumina Анализатор генома во время секвенирования de novo. Алгоритм, названный SOAPdenovo, может собрать геном за два дня и был использован для сборки массива геномов растений и животных.
SOAPdenovo является частью «Short Oligonucleotide Analysis Package » (SOAP), набор инструментов, разработанный BGI для de novo сборки геномов человеческого размера, выравнивания, обнаружения SNP, повторного секвенирования, поиска инделений и анализа структурных вариаций. SOAPdenovo, созданный для коротких считываний секвенсоров Illumina, использовался для сборки нескольких геномов человека (идентификация вставки длиной восемь килобаз, не обнаруженной путем сопоставления с эталонным геномом человека) и животных, таких как гигантская панда.
Вплоть до В 2015 году BGI выпустила BGISEQ-100 на основе устройства Ion Torrent от Thermo Fisher Scientific и BGISEQ-1000 на основе аналогичной технологии от Complete Genomics, оба из которых получили одобрение CFDA на пренатальный тест NIFTY (неинвазивный тест на трисомию плода). В октябре 2015 года BGI запустила BGISEQ-500, большую настольную систему секвенирования, которая через год получила одобренную регистрацию в качестве медицинского устройства CFDA. Сообщается, что он получил более 500 заказов на систему и провел более 112 000 тестов до конца 2016 года. Китайский национальный генетический банк, открытый BGI и правительством Китая в сентябре 2016 года, насчитывает 150 инструментов системы. BGISEQ-500 был разработан как платформа для секвенирования, способная конкурировать с платформами Illumina своим качеством и низкой ценой. В ноябре 2016 года BGI выпустила BGISEQ-50, миниатюрную версию настольного секвенсора. В 2017 году BGI начала предлагать WGS по цене 600 долларов. В октябре 2017 года MGI Tech, дочерняя компания BGI, выпустила два новых секвенсора MGISEQ-2000 и MGISEQ-200 (позже переименованных в DNBSEQ-G400 и DNBSEQ-G50), а годом позже - DNBSEQ-T7.
25 августа 2020 года Reuters сообщило, что около 3700 человек в Швеции ошибочно сообщили, что у них есть коронавируса из-за неисправности набора для тестирования COVID-19 от BGI Genomics.