Атомная астрофизика занимается выполнением расчетов по атомной физике, которые будут полезны астрономам и использование атомных данных для интерпретации астрономических наблюдений. Атомная физика играет ключевую роль в астрофизике, поскольку только информация астрономов об определенном объекте поступает через свет, который он излучает, и этот свет возникает через атомные переходы.
Молекулярная астрофизика, разработанная астрохимиком-теоретиком Александром Далгарно в 1967 году в область строгих исследований, касается изучения излучения молекул . в космосе. В настоящее время известно 110 межзвездных молекул. Эти молекулы имеют большое количество наблюдаемых переходов. Линии также могут наблюдаться в поглощении - например, линии с сильным красным смещением на фоне гравитационно линзированного квазара PKS1830-211. Излучение высокой энергии, такое как ультрафиолет, может разорвать молекулярные связи, удерживающие атомы в молекулах. В общем, молекулы находятся в прохладной астрофизической среде. Самые массивные объекты в нашей галактике - это гигантские облака молекул и пыли, известные как гигантские молекулярные облака. В этих облаках и их уменьшенных версиях образуются звезды и планеты. Одной из основных областей изучения молекулярной астрофизики является формирование звезд и планет. Однако молекулы можно найти во многих средах, от звездных атмосфер до планетных спутников. Большинство из этих мест относительно холодные, и молекулярную эмиссию легче всего изучить с помощью фотонов, испускаемых, когда молекулы совершают переходы между состояниями с низкой вращательной энергией. Одна молекула, состоящая из большого количества атомов углерода и кислорода и очень устойчивая к диссоциации на атомы, - это монооксид углерода (CO). Длина волны фотона, испускаемого, когда молекула CO падает из своего нижнего возбужденного состояния в нулевое энергетическое или основное состояние, составляет 2,6 мм, или 115 гигагерц. Эта частота в тысячу раз выше обычных частот FM-радио. На этих высоких частотах молекулы в атмосфере Земли могут блокировать передачи из космоса, и телескопы должны быть размещены в сухих (вода - важный атмосферный блокатор) на возвышенностях. Радиотелескопы должны иметь очень точные поверхности для получения изображений с высокой точностью.
21 февраля 2014 года НАСА объявило о значительно обновленной базе данных для отслеживания полициклических ароматических углеводородов (ПАУ) во вселенной .. По мнению ученых, более 20% углерода во Вселенной могут быть связаны с ПАУ, возможными исходными материалами для образования жизни. Похоже, что ПАУ образовались вскоре после Большого взрыва, широко распространены по всей вселенной и связаны с новыми звездами и экзопланетами.