Аполипопротеин A1

редактировать
APOA1
PBB Protein APOA1 image.jpg
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы APOA1, entrez: 335, apo (a), аполипопротеин A1, аполипопротеин AI, HPALP2
Внешние идентификаторыOMIM: 107680 MGI: 88049 HomoloGene : 47900 GeneCards: APOA1
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человека)
Chr. Хромосома 11 (человек)
Хромосома 11 (человека) Расположение в геноме APOA1 Расположение в геноме APOA1
Полоса 11q23.3Начало116,835,751 bp
Конец116,837,950 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE APOA1 204450 x при fs.png .. PBB GE AP OA1 217073 x в fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

335

11806

Ensembl

ENSG00000118137

ENSMUSG00000032083

UniProt

P02647

Q00623

RefSeq (mRNA)

NM_000039. <1380131>NM_000039. <13801>NM_00131>NM_001318021

NM_009692

RefSeq (белок)

NP_033822

Местоположение (UCSC)Chr 11: 116,84 - 116,84 Мб Chr 9: 46,23 - 46,23 Мб
PubMed search
Wikidata
View / Edit Human View / Edit Mouse

Аполипопротеин A1 - это белок, который у человека кодируется геном APOA1 . Он играет особую роль в липидном обмене. Текст в отчете 2014 г. предполагает, что мРНК APOA1 регулируется эндогенно экспрессируемой антисмысловой РНК.

Содержание

  • 1 Структура
  • 2 Функция
  • 3 Приложения
  • 4 Клиническая значимость
    • 4.1 Активность, связанная с высокий уровень ХС-ЛПВП и защита от сердечных заболеваний
    • 4.2 Новые гаплотипы в составе генного кластера аполипопротеина AI-CIII-AIV
    • 4.3 Роль в других заболеваниях
    • 4.4 Эпистатическое воздействие апо A1
    • 4.5 Факторы, влияющие на активность апо A1
  • 5 Взаимодействия
    • 5.1 Потенциальные партнеры связывания
    • 5.2 Интерактивная карта путей
  • 6 См. Также
  • 7 Ссылки
  • 8 Внешние ссылки

Структура

Ген APOA1 расположен на 11-й хромосоме, с его конкретным местоположением 11q23-q24. Ген содержит 4 экзона. APOA1 кодирует белок 45,4 кДа, состоящий из 396 аминокислот; 21 пептид был обнаружен с помощью данных масс-спектрометрии.

Функция

Аполипопротеин A1 является основным белковым компонентом частиц HDL в плазме.

Хиломикроны секретируемые кишечными энтероцитами также содержат апо A1, но он быстро передается в HDL в кровотоке.

Белок, как компонент частиц HDL, обеспечивает отток молекул жира, принимая жиры изнутри клеток ( включая макрофаги в стенках артерий, которые были перегружены проглоченными жирами из окисленных частиц ЛПНП) для транспортировки (в воде вне клеток) в другое место, в том числе обратно в частицы ЛПНП или в печень для выведения.

Он является кофактором лецитинхолестеролацилтрансферазы (ЛХАТ), которая отвечает за образование большинства эфиров холестерина плазмы. Апо A1 также был выделен как стабилизирующий фактор простациклина (PGI2) и, таким образом, может иметь эффект противосвертывания. Дефекты гена, кодирующего его, связаны с дефицитом ЛПВП, включая болезнь Танжера, и с системным ненейропатическим амилоидозом.

. АпоА1 часто используется в качестве биомаркера для прогнозирования сердечно-сосудистых заболеваний. Отношение апоВ-100 / апоА1 (т.е. ЛПНП и более крупные частицы по сравнению с частицами ЛПВП), соотношение липопротеинов, измеренных ЯМР (ЛПНП / ЛПВП ), и даже больше, всегда было более сильным. корреляция с частотой случаев инфаркта миокарда, чем старые методы измерения транспорта липидов в воде вне клеток.

ApoA1 обычно измеряется с помощью иммуноанализов, таких как ELISA или нефелометрия.

Приложения

ApoA1 может быть использован для создания липопротеинов in vitro нанодисков для бесклеточных мембранных систем экспрессии.

Клиническая значимость

Активность, связанная с высоким уровнем ХС-ЛПВП. и защита от сердечных заболеваний

Как основной компонент комплекса липопротеинов высокой плотности (защитные частицы для «удаления жира» ), апо A1 помогает очистить жиры, включая холестерин, из лейкоцитов в стенках артерий, что снижает вероятность перегрузки лейкоцитов в жировые отложения, превращения в пенистые клетки, гибели и участия в прогрессировании эссив атерома. У пяти из девяти мужчин с мутацией (E164X), которым была обнаружена мутация (E164X), в возрасте не менее 35 лет развилась преждевременная ишемическая болезнь сердца. Один из четырех мутантов апо A1 присутствует примерно у 0,3% населения Японии, но обнаруживается у 6% людей с низким уровнем холестерина ЛПВП.

ApoA-1 Milano - это встречающийся в природе мутант апо A1, обнаруженный в нескольких семьях в Лимоне-суль-Гарда, Италия, и, согласно генетическим и церковным данным, детективом генеалогического древа работа, восходящая к одному человеку, Джованни Помарелли, в 18 веке. Описанный в 1980 году, это была первая известная молекулярная аномалия аполипопротеинов. Парадоксально, но у носителей этой мутации очень низкий уровень ХС-ЛПВП (холестерина ЛПВП), но не повышается риск сердечных заболеваний, часто доживающих до 100 лет и старше. Это необычное наблюдение побудило итальянских исследователей отследить происходящее и привело к открытию апо А1 Милан (город Милан, расположенный на расстоянии ~ 160 км, в котором располагалась лаборатория исследователя). Биохимически апо A1 содержит дополнительный цистеиновый мостик, в результате чего он существует как гомодимер или как гетеродимер с апо A-II. Однако усиленная кардиозащитная активность этого мутанта (которая, вероятно, зависит от оттока жира и холестерина) не может быть легко воспроизведена другими мутантами цистеина.

Рекомбинантные димеры аро A1 Milano, приготовленные в липосомах, могут уменьшить атеромы в моделях на животных до 30%. В небольших клинических испытаниях также было показано, что Apo A1 Milano имеет статистически значимый эффект в уменьшении (обращении) образования бляшек на стенках артерий.

В исследованиях на людях изменение образования бляшек измерялось в течение курс пять недель.

Новые гаплотипы в составе генного кластера аполипопротеина AI-CIII-AIV

В последнее время были обнаружены два новых гаплотипа восприимчивости, т.е. P2-S2-X1 и P1-S2-X1 в Кластер генов ApoAI-CIII-AIV на хромосоме 11q23, что дает примерно в три раза более высокий риск ишемической болезни сердца как у нормальных, так и у пациентов с инсулиновым сахарным диабетом.

Роль при других заболеваниях

Полиморфизм AG / A в промоторе гена апо A1 был связан с возрастом, в котором пациенты поступили с болезнью Альцгеймера. Защита от болезни Альцгеймера с помощью апо A1 может зависеть от синергетического взаимодействия с альфа-токоферолом. Амилоид, откладываемый в колене после операции, в основном состоит из апо A1, секретируемого хондроцитами (хрящевые клетки). Широкое разнообразие симптомов амилоидоза связано с редкими мутантами Apo A1.

Апо AI связывается с липополисахаридом или эндотоксином и играет важную роль в антиэндотоксиновой функции HDL.

В одном исследовании, снижение уровней апо A1 было обнаружено в шизофрении пациентов CSF, головном мозге и периферических тканях.

Эпистатическое воздействие апо A1

Аполипопротеин A1 и APOE взаимодействуют эпистатически, модулируя уровни триглицеридов у пациентов с ишемической болезнью сердца. По отдельности ни апо A1, ни апо E не были связаны с уровнями триглицеридов (TG), но парный эпистаз (аддитивная x аддитивная модель) исследовал их значительный синергический вклад с повышенными уровнями TG (P <0.01).

Факторы, влияющие на апо A1 активность

Продукция апо A1 снижается на кальцитриол и увеличивается препаратом, который противодействует ему.

Физические упражнения или лечение статинами могут вызвать повышение в уровнях HDL-C путем индукции продукции апо A1, но это зависит от полиморфизма промотора G / A.

Взаимодействия

Было показано, что аполипопротеин A1 взаимодействует с:

Потенциальные партнеры связывания

Предшественник связывания аполипопротеина A1, родственник APOA-1, сокращенно APOA1BP, имеет предсказанное биохимическое взаимодействие с белок, содержащий углеводный домен киназы. Связь между этими двумя белками подтверждается и. Ортологом CARKD в E. co li содержит домен, которого нет ни в одном ортологе эукариот. Этот домен имеет высокую идентичность последовательности с APOA1BP. CARKD - это белок с неизвестной функцией, и биохимическая основа этого взаимодействия неизвестна.

Интерактивная карта путей

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.

[[File: Statin_Pathway_WP430 [[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]] Statin_Pathway_WP430 | px | alt = Statin Pathway edit ]] Statin Pathway edit

См. Также

Ссылки

Внешние ссылки

.

Последняя правка сделана 2021-06-11 20:33:57
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте