Войти
| Ацидобактерии | |
|---|---|
| Ацидобактерии | |
| Научная классификация | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Ацидобактерии. Thrash and Coates 2012 |
| Класс | |
Acidobacteria- это тип бактерий . Его представители физиологически разнообразны и распространены повсеместно, особенно в почвах, но недостаточно представлены в культуре.
Представители этого типа физиологически разнообразны и могут быть найдены в различных средах, включая почву, горячие источники, океаны, пещеры и загрязненные металлами почвы. Члены этого типа особенно многочисленны в почвенных местообитаниях, составляя до 52% от всего бактериального сообщества. Было замечено, что факторы окружающей среды, такие как pH и питательные вещества, влияют на динамику ацидобактерий. Многие ацидобактерии ацидофильны, в том числе первый описанный член этого типа, Acidobacterium capsulatum.
. Другими известными видами являются Holophaga foetida, Geothrix fermentans, Acanthopleuribacter pedis и. Поскольку они были обнаружены совсем недавно и подавляющее большинство из них не культивировалось, экология и метаболизм этих бактерий изучены недостаточно. Однако эти бактерии могут вносить важный вклад в экосистемы, поскольку они особенно многочисленны в почвах. Было обнаружено, что представители подразделений 1, 4 и 6 особенно многочисленны в почвах.
Помимо их естественной среды обитания в почве, неклассифицированные ацидобактерии подразделения 2 также были определены как загрязнители реагентов набора для экстракции ДНК, которые могут привести к их ошибочному отображению в микробиоте или метагеномных наборах данных.
Было обнаружено, что представители подразделения 1 доминируют в условиях низкого pH. Кроме того, было обнаружено, что ацидобактерии из дренажных вод кислых шахт более приспособлены к кислым условиям pH (pH 2-3) по сравнению с ацидобактериями из почвы, возможно, из-за клеточной специализации и стабильности ферментов.
G Содержание + C в геномах Acidobacteria одинаково внутри их подразделений - более 60% для фрагментов группы V и примерно на 10% ниже для фрагментов группы III.
Большинство Acidobacteria считаются аэробами. В подразделе 8 и подразделе 23 есть некоторые ацидобактерии, которые считаются анаэробами. Было обнаружено, что некоторые штаммы ацидобактерий, происходящие из почвы, обладают геномным потенциалом для вдыхания кислорода при атмосферных и субатмосферных концентрациях.
Члены филума Acidobacteria считаются олиготрофными бактериями из-за их высокой численности в среде с низким содержанием органического углерода. Однако различия в этом типе могут указывать на то, что у них может быть разная экологическая стратегия.
Первый вид, Acidobacterium capsulatum, был обнаружен в 1991 году. Однако ацидобактерии не были признаны новым подразделением до 1997 года и не были признаны филумом до 2012 года.
Некоторые члены подразделения 1 могут использовать D-глюкозу, D-ксилозу и лактозу в качестве источников углерода, но не могут использовать фукозу или сорбозу. Члены подразделения 1 также содержат ферменты, такие как галактозидазы, используемые при расщеплении сахаров. Было обнаружено, что представители подразделения 4 используют хитин в качестве источника углерода.
Нет четких доказательств того, что ацидобактерии участвуют в процессах азотного цикла, таких как как нитрификация, денитрификация или азотфиксация. Однако было показано, что Geothrix fermantans способен восстанавливать нитраты и содержал ген norB. Ген NorB был также идентифицирован у Koribacter verstailis и. Кроме того, присутствие гена nirA наблюдали у представителей подразделения 1. Кроме того, на сегодняшний день описано, что все геномы непосредственно поглощают аммоний через гены семейства транспортеров аммониевых каналов. Ацидобактерии могут использовать как неорганический, так и органический азот в качестве источников азота.
В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN), а филогения основана на высвобождении LTP на основе 16S рРНК 123 от Проект «Живое дерево всех видов».
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Примечания:. ♠ Штаммы, обнаруженные в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не перечисленные в Списке названий прокариот со стоящими в Номенклатура (LSPN)
