APAF1

редактировать
APAF1
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы APAF1, APAF-1, CED4, фактор активации апоптотической пептидазы 1
Внешние идентификаторыOMIM: 602233 MGI: 1306796 HomoloGene: 7626 GeneCards: APAF1
Расположение гена (человек)
Chr. Хромосома 12 (человек)
Группа 12q23.1Начало98 645 141 bp
Конец98,735,433 bp
экспрессия РНК образец




Дополнительные справочные данные по экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

317

11783

Ensem bl

ENSG00000120868

ENSMUSG00000019979

UniProt

O14727

O88879

RefSeq (мРНК)

NM_001160
NM_013229
NM_18186118218367>NM269>NM_18186118218367>>NM_001042558
NM_001282947
NM_009684

RefSeq (белок)

NP_001151
NP_037361
NP_863651
NP_863658
NP_863659

NP_00103>NP_833659

NP_00103>NP_2360700103 262>Местоположение (UCSC)

Chr 12: 98,65 - 98,74 Мб Chr 10: 90,99 - 91,08 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / Edit Mouse

Фактор 1 активации апоптотической протеазы, также известный как APAF1, является человеческим гомологом гена CED-4 C. elegans.

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Структура
  • 3 Взаимодействия
  • 4 Ссылки
  • 5 Внешние ссылки
  • 6 Дополнительная литература
Функция

Этот ген кодирует цитоплазматический белок, который образует один из центральных узлов в апоптоз регуляторная сеть. Этот белок содержит (с N-конца) домен рекрутирования каспазы (CARD ), домен АТФазы (NB-ARC), несколько коротких спиральных доменов, а затем несколько копий WD40 повторяет домен. После связывания цитохрома с и dATP этот белок образует олигомерную апоптосому. Апоптосома связывает и расщепляет белок, высвобождая его зрелую активированную форму. Точный механизм этой реакции все еще обсуждается, хотя работа, опубликованная Гаем Салвесеном, предполагает, что апоптосома может индуцировать димеризацию каспазы-9 и последующий автокатализ. Активированная каспаза-9 стимулирует последующий каскад каспаз, который вызывает апоптоз клетки.

Альтернативный сплайсинг приводит к нескольким вариантам транскрипции, кодирующим разные изоформы.

Структура

APAF1 содержит домен CARD с греческим ключом мотив, состоящий из шести спиралей, нуклеотидсвязывающих доменов укладки Россмана, короткого спирального мотива и домена крылатой спирали.

Взаимодействия

Было показано, что APAF1 взаимодействует с:

Ссылки
Внешние ссылки
  • Human APAF1 расположение генома и страница сведений о гене APAF1 в UCSC Genome Browser.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O14727 (фактор активации апоптотической протеазы 1) в PDBe-KB.
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-06-07 22:08:43
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru