ABO (ген)

редактировать
Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
ABO
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы ABO, A3GALNT, A3GALT1, GTB, NAGAT, группа крови ABO (трансфераза A, альфа-1-3-N-ацетилгалактозаминилтрансфераза; трансфераза B, альфа 1-3-галактозилтрансфераза), альфа 1-3-N-ацетилгалактозаминилтрансфераза и альфа 1-3-галактозилтрансфераза
Внешние идентификаторыOMIM: 110300 MGI : 2135738 HomoloGene: 69306 GeneCard: ABO
Номер EC 2.4.1.37 2.4.1.40, 2.4.1.37
Расположение гена (человек)
Chr. Хромосома 9 (человек)
Полоса 9q34.2Начало133,250,401 bp
конец133,276,024 bp
Экспрессия РНК шаблон


Дополнительные данные эталонной экспрессии
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

28

80908

Ensembl

ENSG00000175164
ENSG00000281879

ENSMUSG00000015787

UniProt <35234>P16

RefSeq (мРНК)

NM_020469

NM_030718
NM_001290444

RefSeq (белок)

NP_065202

NP_001277373
NP_109643

Местоположение (UCSCr): 133,25 - 133,28 Мб Chr 2: 26,84 - 26,86 Мб PubMed поискВикиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Система ABO по гистологической группе крови трансферазапредставляет собой фермент с активностью гликозилтрансферазы, который h кодируется геном ABO у человека. Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток. ABO определяет группу крови ABO индивидуума путем модификации олигосахаридов на гликопротеинах клеточной поверхности. Вариации в последовательности белка у разных людей определяют тип модификации и группу крови. Ген ABO также содержит один из 27 SNP, связанных с повышенным риском ишемической болезни сердца.

Содержание

  • 1 Структура
  • 2 Общие аллели
  • 3 Клиническая значимость
    • 3.1 Клинический маркер
  • 4 Ссылки
  • 5 Дополнительная литература
  • 6 См. Также
  • 7 Внешние ссылки

Структура

Ген ABO находится на хромосоме 9 в полосе 9q34.2 и содержит 7 экзонов. Локус ABO кодирует три аллеля . Аллель A продуцирует α-1,3-N-ацетилгалактозаминтрансферазу (A-трансферазу), которая катализирует перенос остатков GalNAc с донорного нуклеотида UDP-GalNAc на остатки Gal акцептора H-антиген, превращающий H-антиген в A-антиген у индивидуумов A и AB. Аллель B кодирует α-1,3-галактозилтрансферазу (B-трансферазу), которая катализирует перенос остатков Gal от донорного нуклеотида UDP -Gal к остаткам Gal акцепторного антигена H, превращая H-антиген в B-антиген у индивидуумов B и AB. Примечательно, что разница между ферментами гликозилтрансфераз A и B составляет всего четыре аминокислоты. Аллель O лишен обеих ферментативных активностей из-за сдвига рамки считывания, вызванного делецией гуанина-258 в гене, который соответствует области около N-конца белка. Это приводит к сдвигу рамки считывания и трансляции почти полностью другого белка. Эта мутация приводит к белку, неспособному модифицировать олигосахариды, которые заканчиваются фукозой, связанной с галактозой. Таким образом, антиген A или B не обнаруживается у O индивидуумов. Эта комбинация сахаров называется H-антигеном. Эти антигены играют важную роль в совпадении переливания крови и трансплантации органов. Для этого гена были обнаружены другие минорные аллели.

Общие аллели

Есть шесть общих аллелей у лиц европейского происхождения. фенотип гена ABO почти каждого живого человека представляет собой комбинацию только этих шести аллелей:

  • A
    • A101 (A1)
    • A201 (A2)
  • B
    • B101 (B1)
  • O
    • O01 (O1)
    • O02 (O1v)
    • O03 (O2)

Многие редкие варианты этих аллелей были обнаружены в человеческих популяциях по всему миру.

Клиническое значение

В человеческих клетках аллели ABO и кодируемые ими гликозилтрансферазы были описаны при нескольких онкологических состояниях. Используя моноклональные антитела против GTA / GTB, было продемонстрировано, что потеря этих ферментов коррелировала со злокачественным мочевым пузырем и эпителием полости рта. Кроме того, экспрессия антигенов группы крови ABO в нормальных тканях человека зависит от типа дифференцировки эпителия. В большинстве карцином человека, включая карциному полости рта, важным событием как частью основного механизма является снижение экспрессии антигенов A и B. Несколько исследований показали, что относительное подавление GTA и GTB происходит при карциномах полости рта в связи с развитием опухоли. Совсем недавно в рамках полногеномного ассоциативного исследования (GWAS) были выявлены варианты в локусе ABO, связанные с восприимчивостью к раку поджелудочной железы.

Клинический маркер

Мультилокусное исследование генетической оценки риска, основанное на комбинации из 27 локусов, включая ген ABO, идентифицировали людей с повышенным риском как эпизодов, так и рецидивов ишемической болезни сердца, а также повышенного клинического эффекта от терапии статинами. Исследование было основано на когортном исследовании сообщества (исследование Malmo Diet and Cancer) и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22).

Ссылки

Дополнительная литература

См. Также

Внешние ссылки

Викискладе есть носители, относящиеся к ABO (ген) .

Эта статья включает текст из Национальной библиотеки США of Medicine, который находится в общественном достоянии.


Последняя правка сделана 2021-06-07 19:18:24
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте