4-гидроксифенилпируватдиоксигеназа - 4-Hydroxyphenylpyruvate dioxygenase

редактировать
4-гидроксифенилпируватдиоксигеназа
1SP9 Ribbon.png Гомодимер 4-гидроксифенилпируватдиоксигеназы. Красная лента представляет собой железосодержащий каталитический домен (Fe 2+ представлен в виде красно-оранжевых сфер); синий представляет олигомерный домен. Изображение создано из опубликованных структурных данных
Идентификаторы
Номер EC 1.13.11.27
Номер CAS 9029-72-5
Базы данных
IntEnz Представление IntEnz
BRENDA Запись BRENDA
ExPASy Просмотр NiceZyme
KEGG Запись KEGG
MetaCyc метаболический путь
PRIAM профиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Онтология генов AmiGO / QuickGO
4-гидроксифенилпируватдиоксигеназа
Идентификаторы
СимволHPPD
Альт. символыHPD; PPD
ген NCBI 3242
HGNC 5147
OMIM 609695
RefSeq NM_002150
UniProt P32754
Прочие данные
Номер ЕС 1.13.11.27
Locus Chr. 12 q24-qter

4-гидроксифенилпируватдиоксигеназа (HPPD ), также известная как α-кетоизокапроатдиоксигеназа (KIC диоксигеназа ), представляет собой Fe (II) -содержащую негемовую оксигеназу, которая катализирует вторую реакцию в катаболизме тирозин - превращение 4-гидроксифенилпирувата в гомогентизат. HPPD также катализирует превращение фенилпирувата и превращение α-кетоизокапроата в β-гидрокси-β-метилбутират. HPPD - это фермент, который присутствует почти во всех аэробных формах жизни.

Эта реакция показывает превращение 4-гидроксифенилпирувата в гомогентизат под действием HPPD.

Содержание

  • 1 Ферментный механизм
  • 2 Структура
  • 3 Функция
  • 4 Актуальность болезни
  • 5 Промышленное значение
  • 6 Ссылки
  • 7 Дополнительная литература

Ферментный механизм

HPPD - это относятся к классу оксигеназных ферментов, которые обычно используют α-кетоглутарат и двухатомный кислород для оксигенации или окисления целевой молекулы. Однако HPPD отличается от большинства молекул этого класса из-за того, что он не использует α-кетоглутарат, а использует только два субстрата при добавлении обоих атомов двухатомного кислорода в продукт, гомогентизат. Реакция HPPD протекает через сдвиг NIH и включает окислительное декарбоксилирование α-оксокислоты, а также гидроксилирование ароматического кольца гидроксилирования. NIH-сдвиг, который был продемонстрирован в исследованиях по мечению изотопов, включает миграцию алкильной группы с образованием более стабильного карбокатиона. Сдвиг объясняет то, что C3 связан с C4 в 4-гидроксифенилпирувате, но с C5 в гомогентизате. Предсказанный механизм HPPD можно увидеть на следующем рисунке:

Предлагаемый механизм реакции HPPD

Структура

HPPD - это фермент, который обычно связывается с образованием тетрамеров в бактериях и димерах в эукариотах и имеет субъединичную массу 40-50 кДа. Разделив фермент на N-конец и C-конец, можно заметить, что N-конец различается по составу, в то время как C-конец остается относительно постоянным (C-конец у растений немного отличается от С-конца у других существ). В 1999 году была создана первая рентгеновская кристаллография структура HPPD, и с тех пор было обнаружено, что активный центр HPPD полностью состоит из остатков около С-конца фермент. Активный сайт HPPD не был полностью картирован, но известно, что этот сайт состоит из иона железа , окруженного аминокислотами, идущими внутрь от бета-листов (за исключением С-концевую спираль). Хотя о функции N-конца фермента известно еще меньше, ученые обнаружили, что одно изменение аминокислоты в N-концевой области может вызвать заболевание, известное как хавкинсинурия.

Функция

Почти у всех аэробных существ 4-гидроксифенилпируват диоксигеназа отвечает за превращение 4-гидроксифенилпирувата в гомогентизат. Это преобразование является одним из многих этапов расщепления L-тирозина на ацетоацетат и фумарат. В то время как все продукты этого цикла используются для создания энергии, растения и эукариоты более высокого порядка используют HPPD по гораздо более важной причине. У эукариот HPPD используется для регулирования уровня тирозина в крови, и растения используют этот фермент для выработки кофакторов пластохинона и токоферола, которые необходимы для выживания растения.

Актуальность заболевания

HPPD может быть связан с одним из самых старых известных наследственных метаболических нарушений, известных как алкаптонурия, которое вызвано низким уровнем гомогентизата в кровотоке. HPPD также напрямую связан с тирозинемией III типа Когда концентрация активного фермента HPPD в организме человека низкая, это приводит к высокому уровню концентрации тирозина в крови, что может вызвать умеренную умственную отсталость при рождении, и ухудшение зрения по мере взросления пациента.

При тирозинемии типа I другой фермент, фумарилацетоацетатгидролаза, мутирует и не работает, что приводит к очень опасным заболеваниям. продукты, накапливающиеся в организме. Фумарилацетоацетатгидролаза действует на тирозин после того, как действует HPPD, поэтому ученые, работающие над созданием гербицидов из класса ингибиторов HPPD, предположили, что ингибирование HPPD и контроль тирозина в рационе могут лечить это заболевание. Была предпринята серия небольших клинических испытаний с одним из их соединений, нитисинон, которые были успешными, что привело к тому, что нитисинон был выпущен на рынок как орфанный препарат.

Промышленное применение

Из-за роли HPPD в производстве необходимых кофакторов в растениях, на рынке имеется несколько ингибиторов HPPD гербицидов, которые блокируют активность этого фермента, и ведутся исследования для поиска новых.

Ссылки

Дополнительная литература

Последняя правка сделана 2021-07-19 01:30:10
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте