1990-е годы в Республике Конго, начиная с коллапса Народная Республика Конго однопартийное правительство и обещание многопартийной демократии постепенно переросли в политическую полемику, кульминацией которой стала Гражданская война 1997-99 гг.
После десятилетий бурной политики в 1992 году Конго завершило переход к многопартийной демократии. Завершая долгую историю однопартийного марксистского правления, конкретная повестка дня для этого перехода была изложена на национальной конференции Конго в 1991 г. и завершилась в августе 1992 г. многопартийными президентскими выборами. Сассу-Нгессо признал поражение, и новый президент Конго, профессор Паскаль Лиссуба, вступил в должность 31 августа 1992 года.
Конголезская демократия пережила суровые испытания в 1993 и начале 1994 года. Президент распустил Национальный Ассамблея в ноябре 1992 года, призвав к новым выборам в мае 1993 года. Результаты этих выборов вызвали насильственные гражданские беспорядки в июне и снова в ноябре. В феврале 1994 г. решения международной коллегии арбитров были приняты всеми сторонами, и риск крупномасштабного восстания снизился.
Однако демократический прогресс Конго в 1997 г. затормозился. Приближались президентские выборы, назначенные на июль 1997 г. напряженность между лагерями Лиссуба и Сассу нарастала. Конголезская армия, лояльная президенту Лиссубе, 5 июня атаковала резиденцию Сассу в Браззавиле. Хотя армия заявляла, что операция была направлена на поиск оружия, Сассу использовал этот инцидент как casus belli для вооруженного восстания, вызвав тем самым Четырехмесячный конфликт, который разрушил или повредил большую часть Браззавиля. В сентябре Лиссуба объехал юг и центральную часть Африки, прося помощи у правительств Руанды, Уганды и Намибии. Лоран Кабила, новый президент ДРК, послал сотни солдат в Браззавиль, чтобы сражаться на стороне Лиссубы. Около 1000 ангольских танков, солдат, истребителей МиГ и оружия, подаренных французским правительством, поддержали повстанцев Сассу. Вместе эти силы взяли Браззавиль и Пуэнт-Нуар утром 16 октября. Лиссуба бежал из столицы, в то время как его солдаты сдались, а граждане начали грабить. Франция объявила о готовности своих 600 граждан в Браззавиле, в основном нефтяников, к эвакуации, но в конечном итоге отказалась от этой меры. Вскоре после этого Сассу объявил себя президентом и назначил правительство из 33 членов.
В январе 1998 года режим Сассу провел Национальный форум за примирение, чтобы определить характер и продолжительность переходного периода. Форум, жестко контролируемый правительством, решил, что выборы должны быть проведены примерно через три года, избрал переходный консультативный законодательный орган и объявил, что конституционное собрание завершит работу над проектом конституции. Однако вспыхнувшая в конце 1998 года борьба между правительственными силами Сассу и вооруженной оппозицией нарушила переходный период восстановления демократии. Это новое насилие также закрыло экономически важную железную дорогу Браззавиль-Пуэнт-Нуар; вызвали огромные разрушения и человеческие жертвы на юге Браззавиля, а также в районах Пул, Буэнза и Ниари; и перемещенные сотни тысяч человек. Однако в ноябре и декабре 1999 года правительство подписало соглашения с представителями многих, хотя и не всех, повстанческих групп. Декабрьское соглашение при посредничестве президента Габона Омара Бонго содержало призыв к дальнейшим, всеобъемлющим политическим переговорам между правительством и оппозицией.