Войти
18S рибосомная РНК (сокращенно 18S рРНК ) является частью рибосомальной РНК. Буква S в 18S представляет единиц Сведберга. 18S рРНК представляет собой SSU рРНК, компонент эукариот (40S ). 18S рРНК представляет собой структурную РНК для небольшого компонента цитоплазматических рибосом эукариот и, таким образом, является одним из основных компонентов всех эукариотических клеток.
18S рРНК является эукариотическим цитозольным гомологом 16S рибосомной РНК в прокариотах и митохондриях.
Гены, кодирующие 18S рРНК обозначают как гены 18S рРНК . Данные о последовательностях этих генов широко используются в молекулярном анализе для реконструкции эволюционной истории организмов, особенно у позвоночных, поскольку их медленная скорость эволюции делает их подходящими для реконструкции древних расхождений.
Ген малой субъединицы (SSU) 18S рРНК является одним из наиболее часто используемых генов в филогенетических исследованиях и важным маркер случайной целевой полимеразной цепной реакции (ПЦР) при скрининге экологического биоразнообразия. В целом последовательности генов рРНК легко доступны благодаря высококонсервативным фланкирующим областям, позволяющим использовать универсальные праймеры. Их повторяющееся расположение в геноме обеспечивает чрезмерное количество матричной ДНК для ПЦР даже в самых маленьких организмах. Ген 18S является частью функционального ядра рибосомы и подвергается одинаковым силам отбора у всех живых существ. Таким образом, когда были опубликованы первые крупномасштабные филогенетические исследования, основанные на последовательностях 18S (например, Field et al., 1988), этот ген был отмечен как главный кандидат на реконструкцию древа метазоа жизнь. Последовательности 18S позже предоставили доказательства расщепления Ecdysozoa и Lophotrochozoa клад (монофилетическая группа организмов, состоящая из общего предка и всех его линейных потомков), что способствовало к самому последнему революционному изменению в нашем понимании взаимоотношений между метазоа.
Однако во второй половине 2000-х, с увеличением числа таксонов, включенных в молекулярные филогении, стали очевидными две проблемы. Во-первых, существуют превалирующие препятствия для секвенирования у представителей определенных таксонов, таких как классы моллюсков Solenogastres и, выбранные таксоны двустворчатых моллюсков, а также загадочный класс ракообразных Remipedia. Неспособность получить последовательности 18S отдельных таксонов считается обычным явлением, но о нем редко когда-либо сообщают. Во-вторых, в отличие от поначалу больших надежд, 18S не может разрешить узлы на всех таксономических уровнях, и его эффективность значительно варьируется между кладами. Это обсуждалось как эффект быстрой древней радиации в течение коротких периодов времени. В настоящее время считается, что мультигенный анализ дает более надежные результаты для отслеживания событий глубокого ветвления у Metazoa, но 18S все еще широко используется в филогенетическом анализе.
Эта статья включает текст CC-By-2.0 из ссылка.
